RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
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PGGT1B-203ENST00000419445 CNPY1Q3B7I2 92 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM219BQ5XKK7 198 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP17Q68EM7 881 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SLFN12LQ6IEE8 588 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
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PGGT1B-203ENST00000419445 CSPG4P5Q96PW8 444 aa3.75□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
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PGGT1B-203ENST00000419445 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa3.74□□□□□ -1.81
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PGGT1B-203ENST00000419445 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa3.74□□□□□ -1.81
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PGGT1B-203ENST00000419445 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 STK39Q9UEW8 545 aa3.74□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 H0Y858 1186 aa3.74□□□□□ -1.81
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PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC35E2BP0CK96 405 aa3.74□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK4P11802 303 aa3.74□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 HMGCS2P54868 508 aa3.74□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL26P61254 145 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ORC1Q13415 861 aa3.74□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 INSCQ1MX18 579 aa3.74□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 NHSL2Q5HYW2 709 aa3.74□□□□□ -1.81
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