RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 USP29Q9HBJ7 922 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB6BQ9NRW1 208 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RGS18Q9NS28 235 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TMLHEQ9NVH6 421 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 NR2E3Q9Y5X4 410 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 NDC80O14777 642 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 B4GALT3O60512 393 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FKTNO75072 461 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 DDHD2O94830 711 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXO21O94952 628 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 LTFP02788 710 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FYNP06241 537 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 IVLP07476 585 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4Q2P0C623 313 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CHN1P15882 459 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CREB1P16220 341 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 OR1G1P47890 313 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CCT5P48643 541 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 STAT4Q14765 748 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNT2Q6UVM3 1135 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 LIAT1Q6ZQX7 453 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TAOK1Q7L7X3 1001 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RELL1Q8IUW5 271 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP4X1Q8N118 509 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PDIK1LQ8N165 341 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 OR10T2Q8NGX3 314 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC110Q8TBZ0 833 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 EPN3Q9H201 632 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNK9Q9NPC2 374 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CNGB3Q9NQW8 809 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PIGVQ9NUD9 493 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 DDIT4Q9NX09 232 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FZD10Q9ULW2 581 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SQORQ9Y6N5 450 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 KBTBD13C9JR72 458 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 M0QZQ0 153 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ARVCFO00192 962 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PIAS1O75925 651 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 EOMESO95936 686 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP11A1P05108 521 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SSTR1P30872 391 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MAP2K2P36507 400 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MMP13P45452 471 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPY1Q01534 308 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TMED2Q15363 201 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 NOMO2Q5JPE7 1267 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 EFHC2Q5JST6 749 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CLLU1OSQ5K130 101 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MFSD5Q6N075 450 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM171BQ6P995 826 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAF7Q6Q0C0 670 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PALM2Q8IXS6 379 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXO36Q8NEA4 188 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 DBF4BQ8NFT6 615 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SCAMP5Q8TAC9 235 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MGARPQ8TDB4 240 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF139Q8WU17 664 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC01599Q8WXQ3 324 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 NT5C3BQ969T7 300 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SUSD3Q96L08 255 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 UROC1Q96N76 676 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC25Q96NG3 672 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC2A13Q96QE2 648 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CFHR5Q9BXR6 569 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 DTLQ9NZJ0 730 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PAK5Q9P286 719 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJB4Q9UDY4 337 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 DSEQ9UL01 958 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM17Q9Y577 477 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CFAP69A5D8W1 941 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 HHLA1C9JL84 531 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 F5H423 210 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM72CH0Y354 149 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 H3BRJ5 948 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CDH16O75309 829 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 AVILO75366 819 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TADA2AO75478 443 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 APRTP07741 180 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP5DP30049 168 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ADRA1BP35368 520 aa4.12□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 GRIK1P39086 918 aa4.12□□□□□ -1.75
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