RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402521.7

EFTUD2-201, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,045 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-201ENST00000402521 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 TMEM191CA6NGB0 347 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 TMEM221A6NGB7 291 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 GPR25O00155 361 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 VNN1O95497 513 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 LSM8O95777 96 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 PRKCBP05771 671 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 KRT19P08727 400 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 TMEM191BP0C7N4 346 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 CCDC130P13994 396 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 GARTP22102 1010 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 MAGEA6P43360 314 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 NAMPTP43490 491 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 PTK7Q13308 1070 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 CFAP157Q5JU67 520 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 RABGAP1LQ5R372 815 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 FAM182AQ5T1J6 154 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 ZFP1Q6P2D0 407 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 DPH6Q7L8W6 267 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 ARPINQ7Z6K5 226 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 ZNF554Q86TJ5 538 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC26A11Q86WA9 606 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 TICAM1Q8IUC6 712 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 GLIS1Q8NBF1 620 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 LRRC39Q96DD0 335 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 APOL6Q9BWW8 343 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 HEMGNQ9BXL5 484 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 ETNK2Q9NVF9 386 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 ERAP1Q9NZ08 941 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 TEX264Q9Y6I9 313 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 A0A0B4J269 797 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 H3BNX3 289 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 WEE2P0C1S8 567 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 CXCL8P10145 99 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 BGNP21810 368 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 PRKCHP24723 683 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 CNTFP26441 200 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 FDFT1P37268 417 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 CD97P48960 835 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 TUBB3Q13509 450 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 CCNIQ14094 377 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 MMEL1Q495T6 779 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 MARCH8Q5T0T0 291 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 BBS12Q6ZW61 710 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 ICA1LQ8NDH6 482 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 GAB3Q8WWW8 586 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 SOCS4Q8WXH5 440 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 CPA5Q8WXQ8 436 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 E2F7Q96AV8 911 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 HAUS1Q96CS2 278 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 THTPAQ9BU02 230 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 IFT122Q9HBG6 1241 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 PCDH18Q9HCL0 1135 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 THAP1Q9NVV9 213 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 SQORQ9Y6N5 450 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 OPHN1O60890 802 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 KRT37O76014 449 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 C22orf31O95567 290 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 CLPTM1O96005 669 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 CALB1P05937 261 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 ENO1P06733 434 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 CDK4P11802 303 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 CRHR1P34998 444 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 RAP1GAPP47736 663 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 NR1H2P55055 460 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 SATL1Q86VE3 508 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 SERAC1Q96JX3 654 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 C1orf112Q9NSG2 853 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 PSMD13Q9UNM6 376 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 ZNF236Q9UL36 1845 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 A6NJR5 290 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 E9PBE3 544 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 COPEO14579 308 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC22A2O15244 555 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 CHADO15335 359 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-201ENST00000402521 TLR3O15455 904 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms