RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379225.2

UBAP2-202, Transcript of ubiquitin associated protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene UBAP2, Length 1,809 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2-202ENST00000379225 I6L893 689 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 MBTPS2O43462 519 aa14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 KLKB1P03952 638 aa14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 RARAP10276 462 aa14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 PFKLP17858 780 aa14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 ADRA1BP35368 520 aa14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 NNTQ13423 1086 aa14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 EFHC2Q5JST6 749 aa14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 BRMS1LQ5PSV4 323 aa14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 PYROXD2Q8N2H3 581 aa14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 SMARCD2Q92925 531 aa14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 ASB16Q96NS5 453 aa14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 AP4E1Q9UPM8 1137 aa14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 PAGE1O75459 146 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 IGLV3-27P01718 113 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 KRT1P04264 644 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 KRT7P08729 469 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 RING1Q06587 406 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 PPP2R5DQ14738 602 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 LLGL1Q15334 1064 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 RPS6KA1Q15418 735 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 CA9Q16790 459 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 KCTD6Q8NC69 237 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 RIN3Q8TB24 985 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 CD101Q93033 1021 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 FZD10Q9ULW2 581 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 LRRD1A4D1F6 860 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 SOBPA7XYQ1 873 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 PSTPIP1O43586 416 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 CREB3O43889 395 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 SRGAP2O75044 1071 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 LAMP2P13473 410 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 SLC11A2P49281 568 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 KRT81Q14533 505 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 BOLA3Q53S33 107 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 ALG3Q92685 438 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 KXD1Q9BQD3 176 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 CALN1Q9BXU9 219 aa14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
UBAP2-202ENST00000379225 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 CCDC66A2RUB6 948 aa14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 KCNK3O14649 394 aa14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 CXCR5P32302 372 aa14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 CDH6P55285 790 aa14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 TANGO2Q6ICL3 276 aa14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 CHSY1Q86X52 802 aa14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 RAPGEF5Q92565 580 aa14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 NTAN1Q96AB6 310 aa14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 HES6Q96HZ4 224 aa14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 TLR10Q9BXR5 811 aa14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 OR12D3Q9UGF7 316 aa14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.58□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 CTAGE9A4FU28 777 aa14.57□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 FAM72CH0Y354 149 aa14.57□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 ACSL4O60488 711 aa14.57□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 CD48P09326 243 aa14.57□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 CASQ1P31415 396 aa14.57□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 RWDD2BP57060 319 aa14.57□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.57□□□□□ -0.08
UBAP2-202ENST00000379225 MS4A13Q5J8X5 152 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms