RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF606Q8WXB4 792 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 STOML2Q9UJZ1 356 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 GON4LQ3T8J9 2241 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 GFRA2O00451 464 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 MAP3K13O43283 966 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 FYNP06241 537 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 GNA15P30679 374 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 LIMK1P53667 647 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGAP44Q17R89 818 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 MPPE1Q53F39 396 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 CDKAL1Q5VV42 579 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 CYP2U1Q7Z449 544 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 SCUBE3Q8IX30 993 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 TMEFF1Q8IYR6 380 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 ST7Q9NRC1 585 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 STON1Q9Y6Q2 735 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 BECN2A8MW95 431 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 LATS1O95835 1130 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 IGLV3-27P01718 113 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 NDUFV2P19404 249 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 BPIFB4P59827 614 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 MYL5Q02045 173 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 ADGRF1Q5T601 910 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 ARMCX6Q7L4S7 300 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 LPCAT2Q7L5N7 544 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 GOLGA1Q92805 767 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM62Q9BVG3 475 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 SLC2A11Q9BYW1 496 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 SLC6A17Q9H1V8 727 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 SIX2Q9NPC8 291 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 CYTH4Q9UIA0 394 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 THAP12O43422 761 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 IL12RB1P42701 662 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 PTK2Q05397 1052 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 STPG1Q5TH74 334 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 PIGKQ92643 395 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 SLC4A5Q9BY07 1137 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 ELOVL2Q9NXB9 296 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 DNAJC12Q9UKB3 198 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 NCOR2Q9Y618 2525 aa24.48■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 PATE3B3GLJ2 98 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 PES1O00541 588 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 NCAM1P13591 858 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 PTMSP20962 102 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 USP8P40818 1118 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 PTGER3P43115 390 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 SGSHP51688 502 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 TBX4P57082 545 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM215Q68D42 235 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 UCMAQ8WVF2 138 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 PCDHGC3Q9UN70 934 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 PI4KAP42356 2102 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 CKAP5Q14008 2032 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 TM4SF5O14894 197 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF445P59923 1031 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 RING1Q06587 406 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 ENPP2Q13822 863 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 IL31Q6EBC2 164 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 BEND5Q7L4P6 421 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 UNC45BQ8IWX7 931 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 SORCS1Q8WY21 1168 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 FAM149B1Q96BN6 582 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 MRGPRX1Q96LB2 322 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 CIPCQ9C0C6 399 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 CD93Q9NPY3 652 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 PLCB1Q9NQ66 1216 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-201ENST00000378543 E5RJQ4 531 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 NPC1O15118 1278 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 ACSL4O60488 711 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 HLA-FP30511 346 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 SNX16P57768 344 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF234Q14588 700 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 PPM1JQ5JR12 505 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 SPDYCQ5MJ68 293 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 FKBP15Q5T1M5 1219 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms