RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-201ENST00000366959 PKNOX1P55347 436 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF470Q6ECI4 717 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 KCNMB4Q86W47 210 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 THAP1Q9NVV9 213 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 SEPT3Q9UH03 358 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 E5RJQ4 531 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 PYDC1Q8WXC3 89 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 VPS28Q9UK41 221 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 DIP2BQ9P265 1576 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 KLRC4O43908 158 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 RASSF9O75901 435 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 CD151P48509 253 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 VAC14Q08AM6 782 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 IL17AQ16552 155 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 DEFB106AQ8N104 65 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 HAS1Q92839 578 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 RGL2O15211 777 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 MTERF3Q96E29 417 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 ACTR8Q9H981 624 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 E7ENQ6 273 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 WNT10BO00744 389 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 BANF1O75531 89 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 KRT75O95678 551 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 LRRC55Q6ZSA7 311 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 NUDT18Q6ZVK8 323 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 NDUFA13Q9P0J0 144 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 LACTBL1A8MY62 500 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLCO1B7G3V0H7 640 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 MARC1Q5VT66 337 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 SCUBE2Q9NQ36 999 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 USP32Q8NFA0 1604 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 GAKO14976 1311 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 ADGRB1O14514 1584 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 DDHD2O94830 711 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 DNAJB2P25686 324 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 GPC1P35052 558 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 NPNTQ6UXI9 565 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 SYT15Q9BQS2 421 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 CES2O00748 559 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 ERVK-10P10266 1014 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC2A4P14672 509 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 CDH17Q12864 832 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 PRKAA1Q13131 559 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 DPYSL3Q14195 570 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 FIG4Q92562 907 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 GPR182O15218 404 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 PEX1O43933 1283 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 TPBGLP0DKB5 382 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 HALP42357 657 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 RHOAP61586 193 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 IL5RAQ01344 420 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 LPCAT2Q7L5N7 544 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 SYTL2Q9HCH5 934 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 SNX3O60493 162 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 MLNP12872 115 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF614Q8N883 585 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 STK32AQ8WU08 396 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 KLHL25Q9H0H3 589 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 LRCH1Q9Y2L9 728 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 140.9 ms