RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356183.8

GTF3C1-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-201ENST00000356183 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ATF7IP2Q5U623 682 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 DHRSXQ8N5I4 330 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 GORASP1Q9BQQ3 440 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 GPAMQ9HCL2 828 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 GSG1L2A8MUP6 293 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PSMG1O95456 288 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 HLA-DQA2P01906 255 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 VAV1P15498 845 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 RHAGQ02094 409 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PKN1Q16512 942 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ACTRT1Q8TDG2 376 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CDRT15Q96T59 188 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 GALNT8Q9NY28 637 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 UBP1Q9NZI7 540 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 HECW2Q9P2P5 1572 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 TAF6LQ9Y6J9 622 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 NCAPD2Q15021 1401 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 SLCO1B7G3V0H7 640 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 FCHO1O14526 889 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 TP73O15350 636 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 SCGNO76038 276 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PON1P27169 355 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CASP5P51878 434 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 SPIRE1Q08AE8 756 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PTPAQ15257 358 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF677Q86XU0 584 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 DNAAF5Q86Y56 855 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 SETD9Q8NE22 299 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ITFG1Q8TB96 612 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 COG5Q9UP83 839 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 HEG1Q9ULI3 1381 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 RIPK2O43353 540 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 C21orf2O43822 256 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 NPTXRO95502 500 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 MTTPP55157 894 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CAMKK1Q8N5S9 505 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CCDC167Q9P0B6 97 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 DBTP11182 482 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 RARGP13631 454 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 RALGDSQ12967 914 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 SEZ6Q53EL9 994 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 LDHDQ86WU2 507 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 TMC2Q8TDI7 906 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 UGT2B28Q9BY64 529 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ING4Q9UNL4 249 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ETS2P15036 469 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CD44P16070 742 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 STARD3Q14849 445 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 TAF13Q15543 124 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 FIGNQ5HY92 759 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ERO1BQ86YB8 467 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ARHGEF19Q8IW93 802 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CARNMT1Q8N4J0 409 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF276Q8N554 614 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 HPDLQ96IR7 371 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 POMKQ9H5K3 350 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.64e-6■■■■■ 69.4
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A087WXM4 84 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PIK3CDO00329 1044 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CYP27B1O15528 508 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 FGRP09769 529 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 UMPSP11172 480 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CDKAL1Q5VV42 579 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 SERAC1Q96JX3 654 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 GMEB1Q9Y692 573 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 WDR27A2RRH5 827 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ASS1P00966 412 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CD4P01730 458 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CCNA2P20248 432 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CNTFP26441 200 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ALDH1A3P47895 512 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CCDC80Q76M96 950 aa11.28□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC22A9Q8IVM8 553 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms