RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 URODP06132 367 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 WSCD1Q658N2 575 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 KCNMB4Q86W47 210 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TMEM86AQ8N2M4 240 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TAGLN3Q9UI15 199 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 E9PBE3 544 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 KLHL41O60662 606 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 DUPD1Q68J44 220 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 ADCK2Q7Z695 626 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SERPINB11Q96P15 392 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 EFCAB1Q9HAE3 211 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SERPIND1P05546 499 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 DDX5P17844 614 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 PTK2BQ14289 1009 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 GRTP1Q5TC63 336 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SCUBE1Q8IWY4 988 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 CLEC4FQ8N1N0 589 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 ALG3Q92685 438 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 PPP2R3CQ969Q6 453 aa21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 RAMP2O60895 175 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 NOS2P35228 1153 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SCNN1BP51168 640 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 DRG2P55039 364 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TMEM154Q6P9G4 183 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TKTL2Q9H0I9 626 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
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NISCH-201ENST00000345716 ITGA9Q13797 1035 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 LZTR1Q8N653 840 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 WNT8BQ93098 351 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 ETNK2Q9NVF9 386 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 MPOP05164 745 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 PTPN4P29074 926 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 NPY2RP49146 381 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 RENBPP51606 427 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-201ENST00000345716 SPANXN3Q5MJ09 141 aa21.27■■□□□ 1
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NISCH-201ENST00000345716 ZNF333Q96JL9 665 aa21.27■□□□□ 0.99
NISCH-201ENST00000345716 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.27■□□□□ 0.99
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NISCH-201ENST00000345716 HSFY1Q96LI6 401 aa21.26■□□□□ 0.99
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NISCH-201ENST00000345716 TBKBP1A7MCY6 615 aa21.26■□□□□ 0.99
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NISCH-201ENST00000345716 RPL22P35268 128 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
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NISCH-201ENST00000345716 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.25■□□□□ 0.99
NISCH-201ENST00000345716 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.25■□□□□ 0.99
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NISCH-201ENST00000345716 FAM162AQ96A26 154 aa21.25■□□□□ 0.99
NISCH-201ENST00000345716 LRRC39Q96DD0 335 aa21.25■□□□□ 0.99
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