RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294702.5

GFI1-201, Transcript of growth factor independent 1 transcriptional repressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GFI1, Length 2,784 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1-201ENST00000294702 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
GFI1-201ENST00000294702 MYL4P12829 197 aa20.15■□□□□ 0.82
GFI1-201ENST00000294702 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.15■□□□□ 0.82
GFI1-201ENST00000294702 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
GFI1-201ENST00000294702 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
GFI1-201ENST00000294702 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
GFI1-201ENST00000294702 C8BP07358 591 aa20.14■□□□□ 0.82
GFI1-201ENST00000294702 BNIP3Q12983 259 aa20.14■□□□□ 0.82
GFI1-201ENST00000294702 ITPK1Q13572 414 aa20.14■□□□□ 0.82
GFI1-201ENST00000294702 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.14■□□□□ 0.82
GFI1-201ENST00000294702 LGSNQ5TDP6 509 aa20.14■□□□□ 0.82
GFI1-201ENST00000294702 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
GFI1-201ENST00000294702 DSELQ8IZU8 1212 aa20.14■□□□□ 0.82
GFI1-201ENST00000294702 VCPIP1Q96JH7 1222 aa20.14■□□□□ 0.82
GFI1-201ENST00000294702 SLC29A1Q99808 456 aa20.14■□□□□ 0.82
GFI1-201ENST00000294702 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.14■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 SLC16A4O15374 487 aa20.14■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 SPAG6O75602 509 aa20.14■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 SERPINB2P05120 415 aa20.14■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 IKBKEQ14164 716 aa20.14■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 SMTNL2Q2TAL5 461 aa20.14■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 MCEEQ96PE7 176 aa20.14■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.14■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 H3BMQ9 156 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 CCDC130P13994 396 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 IL23RQ5VWK5 629 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 KRT80Q6KB66 452 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 COG8Q96MW5 612 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 SERPINI1Q99574 410 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 CGREF1Q99674 301 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 AMNQ9BXJ7 453 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 CROCCQ5TZA2 2017 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 CFLARO15519 480 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 AQP9O43315 295 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 GAS7O60861 476 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 PRKCHP24723 683 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 SERPINB5P36952 375 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 DPP6P42658 865 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 GTF2BQ00403 316 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 KCNT1Q5JUK3 1230 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 SPOPLQ6IQ16 392 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 GIN1Q9NXP7 522 aa20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 CYP2C9P11712 490 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 SHMT1P34896 483 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 RCVRNP35243 200 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 GABRB2P47870 512 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 KCNJ11Q14654 390 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 HM13Q8TCT9 377 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 NOX1Q9Y5S8 564 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 CCDC162PA2VCL2 907 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 KRT38O76015 456 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 CSPG5O95196 566 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 S100A1P23297 94 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 UBXN2AP68543 259 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 SLC15A4Q8N697 577 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 HGH1Q9BTY7 390 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 OSBPL11Q9BXB4 747 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 POPDC2Q9HBU9 364 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 FGFR3P22607 806 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 ESRRGP62508 458 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 NR1D2Q14995 579 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 CEP55Q53EZ4 464 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 SNX32Q86XE0 403 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 C10orf107Q8IVU9 208 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 KYQ8NBH2 561 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 ATP6V1E2Q96A05 226 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 CXorf21Q9HAI6 301 aa20.12■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 GNPATO15228 680 aa20.11■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 DGKIO75912 1065 aa20.11■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 ACO1P21399 889 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 GRM5P41594 1212 aa20.11■□□□□ 0.81
GFI1-201ENST00000294702 PCLAFQ15004 111 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms