RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 PIK3CDO00329 1044 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CD4P01730 458 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PRKACBP22694 351 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 GTF2H3Q13889 308 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TCP10LQ8TDR4 215 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CDH19Q9H159 772 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 NTSR2O95665 410 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 HMBOX1Q6NT76 420 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RRM2BQ7LG56 351 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FGD2Q7Z6J4 655 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TTC7BQ86TV6 843 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ITPKCQ96DU7 683 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 NAGPAQ9UK23 515 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 LINGO3P0C6S8 592 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 VBP1P61758 197 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TTC23Q5W5X9 447 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RNF135Q8IUD6 432 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 VPS33AQ96AX1 596 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TBATAQ96M53 351 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RAB6BQ9NRW1 208 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PAK5Q9P286 719 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 M0QYV0 167 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RBBP7Q16576 425 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 C11orf91Q3C1V1 193 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ZBTB46Q86UZ6 589 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 IFT43Q96FT9 208 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 DCUN1D1Q96GG9 259 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FSD1LQ9BXM9 530 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 MYO1DO94832 1006 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 GH1P01241 217 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 NPR3P17342 541 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PRKACAP17612 351 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 AKAP5P24588 427 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ACADSBP45954 432 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF222Q9UK12 451 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 A0A087X0T9 212 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 H7C0S8 307 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 KATNA1O75449 491 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 FOSL1P15407 271 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 HOXD12P35452 270 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SNAPC2Q13487 334 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 DPYSQ14117 519 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 POTEGQ6S5H5 508 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 APOPT1Q96IL0 206 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CCNE2O96020 404 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 APRTP07741 180 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 EFR3AQ14156 821 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 BMP10O95393 424 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PRKCBP05771 671 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CNTFP26441 200 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PDK4Q16654 411 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CDO1Q16878 200 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SLC26A11Q86WA9 606 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 GPRASP2Q96D09 838 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PSMD13Q9UNM6 376 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CPA3P15088 417 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 MED15Q96RN5 788 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM260Q9NX78 707 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 BCAP31P51572 246 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF394Q53GI3 561 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 KCNK18Q7Z418 384 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 AMIGO2Q86SJ2 522 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms