RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 PLIN3O60664 434 aa15.39■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PROCP04070 461 aa15.39■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 CYP2F1P24903 491 aa15.39■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 IDH3AP50213 366 aa15.39■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 GBE1Q04446 702 aa15.39■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 CFAP157Q5JU67 520 aa15.39■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 RSPH3Q86UC2 560 aa15.39■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 NCAPG2Q86XI2 1143 aa15.39■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 NCSTNQ92542 709 aa15.39■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 SORT1Q99523 831 aa15.39■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 GORASP1Q9BQQ3 440 aa15.39■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 MINDY3Q9H8M7 445 aa15.39■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PICK1Q9NRD5 415 aa15.39■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PNPOQ9NVS9 261 aa15.39■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 BTBD7Q9P203 1132 aa15.39■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 WDR27A2RRH5 827 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PEX10O60683 326 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 GLRA3O75311 464 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ALDH1A2O94788 518 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PRKCGP05129 697 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ARRB2P32121 409 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 NDST1P52848 882 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 NIPAL4Q0D2K0 466 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PRKG1Q13976 671 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 STEAP4Q687X5 459 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 LCLAT1Q6UWP7 414 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 CYS1Q717R9 158 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ACMSDQ8TDX5 336 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ACTRT2Q8TDY3 377 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 FAM167AQ96KS9 214 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 WRNIP1Q96S55 665 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 VRTNQ9H8Y1 702 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 CDH22Q9UJ99 828 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 A0A1B0GVG6 124 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 MDM4O15151 490 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 GAS2O43903 313 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 IQCF3P0C7M6 154 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 UQCRBP14927 111 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PEX2P28328 305 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 RPS6KA3P51812 740 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 AQP4P55087 323 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 SEMA5AQ13591 1074 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 LY6KQ17RY6 165 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 OLFML1Q6UWY5 402 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PACS1Q6VY07 963 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 C10orf107Q8IVU9 208 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 TBCBQ99426 244 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 CENPKQ9BS16 269 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 KLHL4Q9C0H6 718 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 MAF1Q9H063 256 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 VPS33BQ9H267 617 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 DNAJC28Q9NX36 388 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ZNF112Q9UJU3 913 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 TNFSF13BQ9Y275 285 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 NR2E3Q9Y5X4 410 aa15.38■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ZNF195O14628 629 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 SERPINE1P05121 402 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 SDC4P31431 198 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ATICP31939 592 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 HDAC4P56524 1084 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 MBTD1Q05BQ5 628 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 MED21Q13503 144 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PDPK2PQ6A1A2 396 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 METTL7BQ6UX53 244 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 C12orf29Q8N999 325 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 GDPD5Q8WTR4 605 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 HPDLQ96IR7 371 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 MAGEB5Q9BZ81 275 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 MIS12Q9H081 205 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 CYP4F11Q9HBI6 524 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 HACL1Q9UJ83 578 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 C19orf81C9J6K1 198 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 STAG3L1P0CL83 205 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 GRIA2P42262 883 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 CRADDP78560 199 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 INCA1Q0VD86 236 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 CUL3Q13618 768 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PMF1Q6P1K2 205 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 KCNT2Q6UVM3 1135 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 EEPD1Q7L9B9 569 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 CHST13Q8NET6 341 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms