RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 MARK4Q96L34 752 aa8.96□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.96□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 ZNF778Q96MU6 729 aa8.96□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 SYBUQ9NX95 663 aa8.96□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.96□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.96□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa8.96□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 C2CD2LO14523 706 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 GLRBP48167 497 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 MAP3K7CLP57077 242 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 KBTBD2Q8IY47 623 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 OR52K1Q8NGK4 314 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 E2F7Q96AV8 911 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 KLC2Q9H0B6 622 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 VPS33BQ9H267 617 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PIDD1Q9HB75 910 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 DNAH14Q0VDD8 3507 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 F8W810 466 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 NEMP1O14524 444 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 NRP1O14786 923 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 TREHO43280 583 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 APOEP02649 317 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 CALB2P22676 271 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 SULT1E1P49888 294 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 RIPK1Q13546 671 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 ZNF460Q14592 562 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 TAZQ16635 292 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 C4orf50Q6ZRC1 276 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PIGZQ86VD9 579 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 OSTM1Q86WC4 334 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 ERO1BQ86YB8 467 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 RNF148Q8N7C7 305 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PHC3Q8NDX5 983 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 STK32AQ8WU08 396 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 GRAMD1AQ96CP6 724 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PLLPQ9Y342 182 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 RNF103O00237 685 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 DGKIO75912 1065 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 IL18RAPO95256 599 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PTPN4P29074 926 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PGM1P36871 562 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 CDK16Q00536 496 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 ZNF280DQ6N043 979 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 C10orf107Q8IVU9 208 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 TTC16Q8NEE8 873 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PYDC1Q8WXC3 89 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 MFSD3Q96ES6 412 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 NSL1Q96IY1 281 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 NMRK1Q9NWW6 199 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 KCNG1Q9UIX4 513 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 FIS1Q9Y3D6 152 aa8.95□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 A0A1B0GUA9 196 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 M0QYT0 321 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 ZCCHC18P0CG32 403 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 MCF2P10911 925 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 GNAZP19086 355 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PTPN7P35236 360 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 GABRB2P47870 512 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PDE1BQ01064 536 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 TFDP2Q14188 446 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 CCL14Q16627 93 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 MUM1Q2TAK8 710 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 WSCD1Q658N2 575 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 PID1Q7Z2X4 250 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 OR6J1Q8NGC5 347 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS1-201ENST00000262460 P2RY11Q96G91 374 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms