RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 SYPP08247 313 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 LCP1P13796 627 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 CD6P30203 668 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 ARID5AQ03989 594 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 STILQ15468 1287 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 CNGA2Q16280 664 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 PKDCCQ504Y2 493 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 WDR45BQ5MNZ6 344 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 DEFB124Q8NES8 71 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 CIPCQ9C0C6 399 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 SUSD2Q9UGT4 822 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 CLEC4EQ9ULY5 219 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 UPK3BL1B0FP48 263 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 UPK3BL2E5RIL1 263 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGAP33O14559 1287 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 LATS1O95835 1130 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 GNSP15586 552 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 OXTRP30559 389 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 DAOAP59103 153 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF234Q14588 700 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 ADGRF1Q5T601 910 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 FOXR2Q6PJQ5 311 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 TMPRSS6Q8IU80 811 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 SLC35F5Q8WV83 523 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 IRGQQ8WZA9 623 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 BICDL2A1A5D9 508 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 TSPAN3O60637 253 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 OPHN1O60890 802 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 FOXC1Q12948 553 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 SEMA3BQ13214 749 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 TFAP2BQ92481 460 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 SIPA1Q96FS4 1042 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 CD93Q9NPY3 652 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 RGS7P49802 495 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 PMF1Q6P1K2 205 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 GOLGA1Q92805 767 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 HSFY1Q96LI6 401 aa21.96■■□□□ 1.11
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NEDD8-201ENST00000250495 FSCN3Q9NQT6 498 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 PLA2G4CQ9UP65 541 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
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NEDD8-201ENST00000250495 EPHX1P07099 455 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 ACADMP11310 421 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 NCAM1P13591 858 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 PLEKHG6Q3KR16 790 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM215Q68D42 235 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 TTI2Q6NXR4 508 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 MSANTD2Q6P1R3 559 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 PIP4P1Q86T03 277 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 UNC45BQ8IWX7 931 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 MINDY1Q8N5J2 469 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 EHBP1Q8NDI1 1231 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 CADM4Q8NFZ8 388 aa21.95■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 LMO3Q8TAP4 145 aa21.95■■□□□ 1.1
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NEDD8-201ENST00000250495 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.95■■□□□ 1.1
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NEDD8-201ENST00000250495 TPMTP51580 245 aa21.94■■□□□ 1.1
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NEDD8-201ENST00000250495 SORCS1Q8WY21 1168 aa21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 DNASE2BQ8WZ79 361 aa21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 KAT5Q92993 513 aa21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 NUP58Q9BVL2 599 aa21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 GPR174Q9BXC1 333 aa21.94■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 MEI4A8MW99 385 aa21.93■■□□□ 1.1
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NEDD8-201ENST00000250495 GABBR2O75899 941 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 LTFP02788 710 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 PRKCHP24723 683 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 BRD2P25440 801 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 MAOBP27338 520 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 SLC11A2P49281 568 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 COPAP53621 1224 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 KCNH2Q12809 1159 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD8-201ENST00000250495 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
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