RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240159.8

RNF170-201, Transcript of ring finger protein 170, humanhuman

TSL 2

Gene RNF170, Length 2,023 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170-201ENST00000240159 SLC8B1Q6J4K2 584 aa23.46■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 PCGF5Q86SE9 256 aa23.46■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 CASP10Q92851 521 aa23.46■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 RNF34Q969K3 372 aa23.46■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 SHOC2Q9UQ13 582 aa23.46■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 FAM92AA1XBS5 289 aa23.45■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 DUSP4Q13115 394 aa23.45■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 SLC29A2Q14542 456 aa23.45■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 PSMD5Q16401 504 aa23.45■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa23.45■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 LRRN4Q8WUT4 740 aa23.45■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 SPATA17Q96L03 361 aa23.45■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 OLFM3Q96PB7 478 aa23.45■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa23.45■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 BACE2Q9Y5Z0 518 aa23.45■■□□□ 1.35
RNF170-201ENST00000240159 HCAR3P49019 387 aa23.45■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 GYS2P54840 703 aa23.45■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 SLC45A4Q5BKX6 768 aa23.45■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 PPIL6Q8IXY8 311 aa23.45■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 ARHGAP18Q8N392 663 aa23.45■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 CPT1BQ92523 772 aa23.45■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 ZNF558Q96NG5 402 aa23.45■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 GMIPQ9P107 970 aa23.45■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 NUDT5Q9UKK9 219 aa23.45■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 WDR27A2RRH5 827 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 DCLK1O15075 740 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 MFSD11O43934 449 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 SHBGP04278 402 aa23.44■■□□□ 1.34
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RNF170-201ENST00000240159 TPI1P60174 286 aa23.44■■□□□ 1.34
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RNF170-201ENST00000240159 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 CCDC33Q8N5R6 958 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 SNX10Q9Y5X0 201 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 MSI1O43347 362 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 CAPN2P17655 700 aa23.43■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 KIAA1841Q6NSI8 718 aa23.43■■□□□ 1.34
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RNF170-201ENST00000240159 RELL1Q8IUW5 271 aa23.43■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
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RNF170-201ENST00000240159 NAT8LQ8N9F0 302 aa23.43■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
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RNF170-201ENST00000240159 OR1D2P34982 312 aa23.43■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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RNF170-201ENST00000240159 ANKRD22Q5VYY1 191 aa23.43■■□□□ 1.34
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RNF170-201ENST00000240159 C2CD2LO14523 706 aa23.42■■□□□ 1.34
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RNF170-201ENST00000240159 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 ERCC2P18074 760 aa23.42■■□□□ 1.34
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RNF170-201ENST00000240159 MSANTD2Q6P1R3 559 aa23.42■■□□□ 1.34
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RNF170-201ENST00000240159 EPAS1Q99814 870 aa23.42■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 OSBPL2Q9H1P3 480 aa23.42■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa23.42■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 PAK5Q9P286 719 aa23.42■■□□□ 1.34
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RNF170-201ENST00000240159 GOLGA6L10A6NI86 522 aa23.42■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 HACD1B0YJ81 288 aa23.42■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 TTC4O95801 387 aa23.42■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 GOLGA6DP0CG33 693 aa23.42■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 CCR1P32246 355 aa23.42■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 ACTN2P35609 894 aa23.42■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 FAM182AQ5T1J6 154 aa23.42■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.42■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 TMEM169Q96HH4 297 aa23.42■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 SERPINB11Q96P15 392 aa23.42■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 IL23AQ9NPF7 189 aa23.42■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 COMMD8Q9NX08 183 aa23.42■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa23.42■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 LAG3P18627 525 aa23.41■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 BASP1P80723 227 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 TAF10Q12962 218 aa23.41■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 PPP2R5DQ14738 602 aa23.41■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 KYNUQ16719 465 aa23.41■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.41■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
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