RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 RPTORQ8N122 1335 aa6.51□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 A0A087WWV3 80 aa6.51□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 DIAPH2O60879 1101 aa6.51□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SGPL1O95470 568 aa6.51□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 GLP2RO95838 553 aa6.51□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 LGALS2P05162 132 aa6.51□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 KDELR1P24390 212 aa6.51□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 GNA13Q14344 377 aa6.51□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ERAP2Q6P179 960 aa6.51□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6.51□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 A0A0A0MRY4 1105 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TGM3Q08188 693 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.5□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 UBE2E3Q969T4 207 aa6.5□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ECM29Q5VYK3 1845 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.372e-10■■■□□ 15.9
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SETX-201ENST00000224140 CYP2F1P24903 491 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CNGA3Q16281 694 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PARP15Q460N3 678 aa6.5□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 FGFR4P22455 802 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 THPOP40225 353 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MUC13Q9H3R2 512 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.5□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 SYT15Q9BQS2 421 aa6.5□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 TKTL1P51854 596 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 JAM2P57087 298 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PSMC6P62333 389 aa6.5□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 SLC4A11Q8NBS3 891 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 RNF157Q96PX1 679 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 DMAC2Q9NW81 257 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MMP13P45452 471 aa6.5□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 FAM45AQ8TCE6 357 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 KAT2BQ92831 832 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PEX13Q92968 403 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 EGFL8Q99944 293 aa6.5□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 MAN1A2O60476 641 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MICAL2O94851 1124 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ATG7O95352 703 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CSH1P0DML2 217 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CSH2P0DML3 217 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 GRK3P35626 688 aa6.5□□□□□ -1.37
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