RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mpp5Q9JLB2 675 aa18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NagaQ9QWR8 415 aa18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znhit2Q9QY66 399 aa18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Actl7bQ9QY83 418 aa18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NbnQ9R207 751 aa18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mbtps1Q9WTZ2 1052 aa18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Aldh18a1Q9Z110 795 aa18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kpna7C0LLJ0 499 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gsta4P24472 222 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ItgavP43406 1044 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 S100bP50114 92 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmprss15P97435 1069 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gabpb1Q00420 383 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pdcd1Q02242 288 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spryd7Q3TFQ1 196 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem65Q4VAE3 234 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sp140Q6NSQ5 534 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PoliQ6R3M4 717 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ItpkcQ7TS72 678 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lrfn2Q80TG9 788 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arhgap24Q8C4V1 747 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NaprtQ8CC86 538 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Abhd8Q8R0P8 439 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc35f5Q8R314 524 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pth2rQ91V95 546 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 DarsQ922B2 501 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Them5Q9CQJ0 248 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmed5Q9CXE7 229 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PmpcbQ9CXT8 489 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 VasnQ9CZT5 673 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krt20Q9D312 431 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc22Q9JIG7 627 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 B4galt4Q9JJ04 344 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Msh5Q9QUM7 833 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wnt8bQ9WUD6 350 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm5538W4VSP6 401 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Serpine3E9Q6A2 401 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn1r39G3UWE6 305 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pias1O88907 651 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Crabp2P22935 138 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sycp3P70281 254 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gcnt3Q5JCT0 437 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Elf1Q60775 612 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Has1Q61647 583 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ankrd6Q69ZU8 712 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1105Q7TR58 312 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Itgbl1Q8VDV0 494 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MyocdQ8VIM5 935 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 DeraQ91YP3 318 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Afg3l1Q920A7 789 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trim66Q924W6 1242 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dtwd1Q9D8U7 304 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pgam1Q9DBJ1 254 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ces1bD3Z5G7 567 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp882E9Q4R4 555 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 OgdhlE9Q7L0 1029 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfm1O88998 485 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cxcl9P18340 126 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfy2P20662 777 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PenkP22005 268 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ythdf1P59326 559 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kcnc2Q14B80 642 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Togaram2Q3TYG6 1002 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CochQ62507 552 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nomo1Q6GQT9 1214 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gpsm1Q6IR34 673 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arhgef18Q6P9R4 1021 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Reps2Q80XA6 521 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zdhhc19Q810M5 347 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Acbd3Q8BMP6 525 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pcdhb2Q91Y00 799 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pcdhac2Q91Y09 1006 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kdm8Q9CXT6 414 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dcaf6Q9DC22 876 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Neu2Q9JMH3 379 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ripk3Q9QZL0 486 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 GghQ9Z0L8 317 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dennd5bA2RSQ0 1274 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sh2d4bA6X942 431 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trim5E9PV98 497 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bmpr2O35607 1038 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Il12aP43431 215 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SnnP61807 88 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ranbp9P69566 653 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 OsbpQ3B7Z2 805 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Otol1Q4ZJM7 482 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prr18Q6PAN7 307 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnajc16Q80TN4 772 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc7a4Q8BLQ7 635 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SowahcQ8C0J6 512 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wdr59Q8C0M0 992 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Amer2Q8CCJ4 672 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Alg9Q8VDI9 611 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr356Q8VFP5 315 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp64Q99KE8 643 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rilpl2Q99LE1 197 aa18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AadacQ99PG0 398 aa18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 96.2 ms