RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641425.1

CASC19-231, Transcript of cancer susceptibility 19, human

Gene CASC19, Length 1,156 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-231	ENST00000641425	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	ANK1	P16157	1881 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CASC19-231	ENST00000641425	VWA8	A3KMH1	1905 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	PODXL	O00592	558 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	PPEF2	O14830	753 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	OGT	O15294	1046 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TEX28	O15482	410 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	ADAM12	O43184	909 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	MBTPS2	O43462	519 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	FAM189A1	O60320	539 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	NPHS1	O60500	1241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TBX10	O75333	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	FUCA1	P04066	466 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	NTRK1	P04629	796 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	CLTA	P09496	248 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	KCNE1	P15382	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	NFKB2	Q00653	900 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	DSG1	Q02413	1049 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	KCNC3	Q14003	757 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	RTP5	Q14D33	572 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	POSTN	Q15063	836 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	ZBTB6	Q15916	424 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	AAK1	Q2M2I8	961 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	BVES	Q8NE79	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	SNX27	Q96L92	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	S1PR5	Q9H228	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TMEM206	Q9H813	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TGM5	O43548	720 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	UROD	P06132	367 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	ADRB2	P07550	413 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	LRPAP1	P30533	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	OR1D2	P34982	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	GLUD2	P49448	558 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	CYP2J2	P51589	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	ARPP19	P56211	112 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	PLP2	Q04941	152 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	PNOC	Q13519	176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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