RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640421.1

SPIN3-238, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,872 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-238	ENST00000640421	SERPINB11	Q96P15	392 aa		18.46	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		18.46	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		18.46	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	F9	P00740	461 aa		18.45	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	CD48	P09326	243 aa		18.45	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	CDC25C	P30307	473 aa		18.45	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	RWDD2B	P57060	319 aa		18.45	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		18.45	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	MS4A14	Q96JA4	679 aa		18.45	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	18.45	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	CLEC1B	Q9P126	229 aa		18.45	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		18.45	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		18.45	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	TBX10	O75333	385 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	OLFM2	O95897	454 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	HMBS	P08397	361 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	KRT7	P08729	469 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	PRLR	P16471	622 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	IGFBP4	P22692	258 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	GBP1	P32455	592 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	ZXDB	P98169	803 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	LLGL1	Q15334	1064 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	FZD10	Q9ULW2	581 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	18.44	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC12A8	A0AV02	714 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	IGLV3-27	P01718	113 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	KRT1	P04264	644 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	ADRA1B	P35368	520 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	ARSE	P51690	589 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	TBX4	P57082	545 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	NNT	Q13423	1086 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	TEAD2	Q15562	447 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	BOLA3	Q53S33	107 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421		Q7L0L9	218 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	TEKT4	Q8WW24	435 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	CARD9	Q9H257	536 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	WDCP	Q9H6R7	721 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	PIDD1	Q9HB75	910 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	GKN1	Q9NS71	199 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	KCNQ1	P51787	676 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	CREG2	Q8IUH2	290 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	WBP2	Q969T9	261 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	NTAN1	Q96AB6	310 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	GCNA	Q96QF7	691 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	NACA2	Q9H009	215 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	LRRD1	A4D1F6	860 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	CEBPB	P17676	345 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	HDC	P19113	662 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	CCR1	P32246	355 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	LTBR	P36941	435 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	GGCX	P38435	758 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	SCAP	Q12770	1279 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	PPP2R5D	Q14738	602 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	GPR149	Q86SP6	731 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	EXD1	Q8NHP7	514 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	ITFG1	Q8TB96	612 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	ING5	Q8WYH8	240 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	RNF34	Q969K3	372 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		18.42	■□□□□ 0.54

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