RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619037.1

CYFIP1-209, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene CYFIP1, Length 575 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-209ENST00000619037 SOWAHDA6NJG2 315 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 C2CD4BA6NLJ0 364 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 IGLV3-27P01718 113 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 MYBL1P10243 752 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 ALADP13716 330 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 PDGFRAP16234 1089 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 GPD1P21695 349 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 SDC4P31431 198 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 GBP1P32455 592 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 HARS2P49590 506 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 GALCP54803 685 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 DEUP1Q05D60 604 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 RING1Q06587 406 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 NNTQ13423 1086 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 MAMLD1Q13495 774 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 GSE1Q14687 1217 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 CDO1Q16878 200 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 SLC25A52Q3SY17 297 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 DCUN1D2Q6PH85 259 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 EDAQ92838 391 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 DNASE1L2Q92874 299 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 ATP2A3Q93084 1043 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 RNF34Q969K3 372 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 NT5C3BQ969T7 300 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 ARHGEF26Q96DR7 871 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 RRN3Q9NYV6 651 aa13.59□□□□□ -0.23
CYFIP1-209ENST00000619037 ANKRD62A6NC57 917 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 PI4K2BG5E9Z4 385 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 NFATC1O95644 943 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 CYP17A1P05093 508 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 FECHP22830 423 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 SOX9P48436 509 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 VCPP55072 806 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 CCDC14Q49A88 953 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 SLC44A4Q53GD3 710 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 RAB6CQ53S08 254 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 NUGGCQ68CJ6 796 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 TMTC1Q8IUR5 882 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 UNC45BQ8IWX7 931 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 CPA6Q8N4T0 437 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 KIAA1958Q8N8K9 716 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 OTUB2Q96DC9 234 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 TRIM7Q9C029 511 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 RAB6CQ9H0N0 254 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 EPHX3Q9H6B9 360 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 ECT2Q9H8V3 914 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 TRPV5Q9NQA5 729 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 ARHGEF3Q9NR81 526 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 PIGVQ9NUD9 493 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 WNT16Q9UBV4 365 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 ZNF510Q9Y2H8 683 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 SCINQ9Y6U3 715 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 PIAS3Q9Y6X2 628 aa13.58□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 KRBA1A5PL33 1030 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 CCP110O43303 1012 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 ACSL4O60488 711 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 APOEP02649 317 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 CYP1A2P05177 515 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 H2AFZP0C0S5 128 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 CCR1P32246 355 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 PTPN9P43378 593 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 GSDMDP57764 484 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 OGDHQ02218 1023 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 SIGLEC14Q08ET2 396 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 DHCR24Q15392 516 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 LY6G5CQ5SRR4 150 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 RHBDF2Q6PJF5 856 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 TRIM67Q6ZTA4 783 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 TPGS1Q6ZTW0 290 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 TPRG1Q6ZUI0 275 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 H2AFVQ71UI9 128 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 TMEM25Q86YD3 366 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 TMEM139Q8IV31 216 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 CCDC170Q8IYT3 715 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 SIX5Q8N196 739 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 NUP85Q9BW27 656 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 SPHK2Q9NRA0 654 aa13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 TMEM191CA6NGB0 347 aa13.56□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 TSPAN3O60637 253 aa13.56□□□□□ -0.24
CYFIP1-209ENST00000619037 F9P00740 461 aa13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms