RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	IL21R	Q9HBE5	538 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	MEI4	A8MW99	385 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	CBFA2T3	O75081	653 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	KIF20A	O95235	890 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	PFKFB1	P16118	471 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	NR2F2	P24468	414 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	PSEN1	P49768	467 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	TPMT	P51580	245 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF234	Q14588	700 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF394	Q53GI3	561 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM215	Q68D42	235 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	DENND1C	Q8IV53	801 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF276	Q8N554	614 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	ARID3A	Q99856	593 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	DUSP16	Q9BY84	665 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-233	ENST00000602338	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GTW7	788 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GVL5	298 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	MAPK13	O15264	365 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	IGLV3-19	P01714	112 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	RALA	P11233	206 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	GNS	P15586	552 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SCAP	Q12770	1279 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SEMA4D	Q92854	862 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	PLXNA2	O75051	1894 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	TULP2	O00295	520 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	HLA-E	P13747	358 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CHKA	P35790	457 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	RAD23B	P54727	409 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	COG7	P83436	770 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	NFIL3	Q16649	462 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB41	Q5JT25	222 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	PIGZ	Q86VD9	579 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CPXM2	Q8N436	756 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CIPC	Q9C0C6	399 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	HPSE	Q9Y251	543 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC12A8	A0AV02	714 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	METTL12	A8MUP2	240 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	NPC1	O15118	1278 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	RHOBTB3	O94955	611 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	EPHX1	P07099	455 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF132	P52740	706 aa		12.5	□□□□□ -0.41

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