RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601358.5

TIMM50-216, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMM50, Length 1,481 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-216ENST00000601358 HOXB2P14652 356 aa22.07■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.07■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 DLL3Q9NYJ7 618 aa22.07■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 GON4LQ3T8J9 2241 aa22.07■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 LAMA1P25391 3075 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 MAP3K13O43283 966 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 MSI1O43347 362 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 PENKP01210 267 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 LTFP02788 710 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 GNA15P30679 374 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 FYB2Q5VWT5 728 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 SCUBE3Q8IX30 993 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 CPXM2Q8N436 756 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 RLN3Q8WXF3 142 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 CACNA1AO00555 2505 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 TSPAN3O60637 253 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 GPD2P43304 727 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 FOXK2Q01167 660 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 APBA1Q02410 837 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 CREB5Q02930 508 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 MAN2A1Q16706 1144 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 FAM149B1Q96BN6 582 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 ERLEC1Q96DZ1 483 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 SPACA7Q96KW9 195 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 ACOX2Q99424 681 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 FBXO10Q9UK96 956 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 HCN2Q9UL51 889 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 SPTBN2O15020 2390 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 NCAM1P13591 858 aa22.04■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 PON1P27169 355 aa22.04■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 ACADSBP45954 432 aa22.04■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 MPPE1Q53F39 396 aa22.04■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 P2RY11Q96G91 374 aa22.04■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 ACP6Q9NPH0 428 aa22.04■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa22.04■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 ZNF806P0C7X5 589 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 MPLP40238 635 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 MSANTD2Q6P1R3 559 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 UNC45BQ8IWX7 931 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 UCMAQ8WVF2 138 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 SART1O43290 800 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 BCKDHBP21953 392 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 GEN1Q17RS7 908 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 VWA3BQ502W6 1294 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 ADGRF1Q5T601 910 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 FAM217AQ8IXS0 508 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 OLIG1Q8TAK6 271 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 NETO1Q8TDF5 533 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 STK32AQ8WU08 396 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 NDST4Q9H3R1 872 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 SMOC1Q9H4F8 434 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 VPS45Q9NRW7 570 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 BECN2A8MW95 431 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 CAPN9O14815 690 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 GDF9O60383 454 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 P2RY2P41231 377 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 SLC11A2P49281 568 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 TBX4P57082 545 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 ZNF445P59923 1031 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 NUGGCQ68CJ6 796 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 PMS2CLQ68D20 193 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 RTKNQ9BST9 563 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 SLC2A11Q9BYW1 496 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 CLEC4EQ9ULY5 219 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 RAD54BQ9Y620 910 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM50-216ENST00000601358 NUP205Q92621 2012 aa22.01■■□□□ 1.11
TIMM50-216ENST00000601358 A0A1W2PQF6 199 aa22.01■■□□□ 1.11
TIMM50-216ENST00000601358 WASH3PC4AMC7 463 aa22.01■■□□□ 1.11
TIMM50-216ENST00000601358 CAVIN2O95810 425 aa22.01■■□□□ 1.11
TIMM50-216ENST00000601358 LATS1O95835 1130 aa22.01■■□□□ 1.11
TIMM50-216ENST00000601358 GABRG2P18507 467 aa22.01■■□□□ 1.11
TIMM50-216ENST00000601358 ARID5AQ03989 594 aa22.01■■□□□ 1.11
TIMM50-216ENST00000601358 PTK2Q05397 1052 aa22.01■■□□□ 1.11
TIMM50-216ENST00000601358 MEA1Q16626 185 aa22.01■■□□□ 1.11
TIMM50-216ENST00000601358 LPCAT2Q7L5N7 544 aa22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms