RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594537.2

LTBP4-211, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene LTBP4, Length 657 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-211ENST00000594537 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa24.09■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 HEPACAM2A8MVW5 462 aa24.08■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 STC2O76061 302 aa24.08■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 GJB6O95452 261 aa24.08■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 CCDC175P0C221 793 aa24.08■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 CCR1P32246 355 aa24.08■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 ARHGAP25P42331 645 aa24.08■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 DEUP1Q05D60 604 aa24.08■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 KIF5AQ12840 1032 aa24.08■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 TANGO2Q6ICL3 276 aa24.08■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 PARM1Q6UWI2 310 aa24.08■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 ZNF662Q6ZS27 426 aa24.08■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 SLC35G2Q8TBE7 412 aa24.08■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 FGF14Q92915 247 aa24.08■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 TBCBQ99426 244 aa24.08■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 TSGA10Q9BZW7 698 aa24.08■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 ANAPC7Q9UJX3 599 aa24.08■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 CCL26Q9Y258 94 aa24.08■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 NUMBLQ9Y6R0 609 aa24.08■■□□□ 1.45
LTBP4-211ENST00000594537 APOEP02649 317 aa24.07■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 PSMC3P17980 439 aa24.07■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 PSMA2P25787 234 aa24.07■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 CXCR3P49682 368 aa24.07■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 ZXDBP98169 803 aa24.07■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa24.07■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 TJAP1Q5JTD0 557 aa24.07■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa24.07■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
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LTBP4-211ENST00000594537 CFAP97Q9P2B7 532 aa24.07■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa24.07■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 MSI1O43347 362 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 RNF8O76064 485 aa24.06■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 SP100P23497 879 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 VIPR2P41587 438 aa24.06■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 AIF1P55008 147 aa24.06■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 VITQ6UXI7 678 aa24.06■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.442e-8■■■■■ 30.6
LTBP4-211ENST00000594537 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 KCNK12Q9HB15 430 aa24.06■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 CHADO15335 359 aa24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 CCP110O43303 1012 aa24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 GREM1O60565 184 aa24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 MAN1A1P33908 653 aa24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 PCK1P35558 622 aa24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 ATP11AP98196 1134 aa24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 NME3Q13232 169 aa24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 Q6ZNB5 142 aa24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 YAF2Q8IY57 180 aa24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 ADAM32Q8TC27 787 aa24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 FAM172AQ8WUF8 416 aa24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 RSPRY1Q96DX4 576 aa24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
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LTBP4-211ENST00000594537 KCNF1Q9H3M0 494 aa24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 WDCPQ9H6R7 721 aa24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 LIMD1Q9UGP4 676 aa24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 STOML2Q9UJZ1 356 aa24.05■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 KRT86O43790 486 aa24.04■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 SLC11A2P49281 568 aa24.04■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 OGDHQ02218 1023 aa24.04■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 PDGFRLQ15198 375 aa24.04■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 ARL13BQ3SXY8 428 aa24.04■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 OSCP1Q8WVF1 389 aa24.04■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 RNF34Q969K3 372 aa24.04■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 NTAN1Q96AB6 310 aa24.04■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 BTN2A3PQ96KV6 586 aa24.04■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 KXD1Q9BQD3 176 aa24.04■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 OSGEPQ9NPF4 335 aa24.04■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 PIGVQ9NUD9 493 aa24.04■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa24.04■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 C5orf42Q9H799 3197 aa24.03■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 KCNU1A8MYU2 1149 aa24.03■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 PROSCO94903 275 aa24.03■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 IRF1P10914 325 aa24.03■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 CHKAP35790 457 aa24.03■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 HDAC4P56524 1084 aa24.03■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa24.03■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 CDO1Q16878 200 aa24.03■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.03■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 LRRC3BQ96PB8 259 aa24.03■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 ADAM33Q9BZ11 813 aa24.03■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 TRIM7Q9C029 511 aa24.03■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 TRPV5Q9NQA5 729 aa24.03■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 RCCD1A6NED2 376 aa24.02■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 HMBSP08397 361 aa24.02■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 SLC1A1P43005 524 aa24.02■■□□□ 1.44
LTBP4-211ENST00000594537 NOP2P46087 812 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
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