RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590096.1

ATG4D-212, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 1,282 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-212ENST00000590096 AOC1P19801 751 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 CHKAP35790 457 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 ZNF75DP51815 510 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 GAD2Q05329 585 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 PON2Q15165 354 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 ANO4Q32M45 955 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 LY6G5CQ5SRR4 150 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 HGSNATQ68CP4 663 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 MON1BQ7L1V2 547 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 PJA1Q8NG27 643 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 SHISA7A6NL88 538 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 LATS1O95835 1130 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 IGLV3-27P01718 113 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 APOEP02649 317 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 GZMAP12544 262 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 GSCP56915 257 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 PTP4A2Q12974 167 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 TPGS1Q6ZTW0 290 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 ARCQ7LC44 396 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 CNGA4Q8IV77 575 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 OLIG1Q8TAK6 271 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 DNAJC7Q99615 494 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 OSBPL6Q9BZF3 934 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 DDIT4Q9NX09 232 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 COX16Q9P0S2 106 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 MIA3Q5JRA6 1907 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.143e-7■■■■□ 19.9
ATG4D-212ENST00000590096 MFAP3LO75121 409 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 IGLV3-25P01717 112 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 SLC11A2P49281 568 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 SULT1E1P49888 294 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 TMEM25Q86YD3 366 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 DRC7Q8IY82 874 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 MCOLN2Q8IZK6 566 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 C3orf20Q8ND61 904 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 CD101Q93033 1021 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 RNF34Q969K3 372 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 SLC39A13Q96H72 371 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 VCPIP1Q96JH7 1222 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 P2RY13Q9BPV8 354 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 TMEM59LQ9UK28 342 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 M0QYT0 321 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 RTN2O75298 545 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 CYBBP04839 570 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 SLC2A3P11169 496 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 KRT3P12035 628 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 FLT3P36888 993 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 NME3Q13232 169 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 DNAJC24Q6P3W2 148 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 CPXM2Q8N436 756 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 AZIN2Q96A70 460 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 CHFRQ96EP1 664 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 NPY6RQ99463 290 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 BBS2Q9BXC9 721 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ATG4D-212ENST00000590096 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 PI15O43692 258 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 DCNP07585 359 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 AVPR2P30518 371 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 CCR1P32246 355 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 GALK1P51570 392 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 LRRC32Q14392 662 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 ARID5BQ14865 1188 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 SLC25A52Q3SY17 297 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 ADGRF1Q5T601 910 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 TMEM51Q9NW97 253 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
ATG4D-212ENST00000590096 MARK1Q9P0L2 795 aa22.14■■□□□ 1.13
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