RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588238.1

UBXN6-205, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

Gene UBXN6, Length 4,598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-205ENST00000588238 RENBPP51606 427 aa15.5■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 SPIRE1Q08AE8 756 aa15.5■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 MORF4L2Q15014 288 aa15.5■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 MRNIPQ6NTE8 343 aa15.5■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 CCDC149Q6ZUS6 474 aa15.5■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 ILDR2Q71H61 639 aa15.5■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 LRRC40Q9H9A6 602 aa15.5■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 OR12D3Q9UGF7 316 aa15.5■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 SERPINF2P08697 491 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 HDCP19113 662 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 ZCWPW2Q504Y3 356 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 MFN1Q8IWA4 741 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 KCNV2Q8TDN2 545 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 TSC22D3Q99576 134 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 PCDH9Q9HC56 1237 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 TCP11X1B4DZS4 312 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 GSTA4O15217 222 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 RHOBTB1O94844 696 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 HECTD3Q5T447 861 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 SZRD1Q7Z422 152 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 FAM35AQ86V20 835 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 TMEM139Q8IV31 216 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 LZTR1Q8N653 840 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 HTR3CQ8WXA8 447 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 SDCCAG3Q96C92 435 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 LRRC37BQ96QE4 947 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 DNPEPQ9ULA0 475 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 DUOX1Q9NRD9 1551 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 CFAP73A6NFT4 308 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 RARGP13631 454 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 ADH1AP07327 375 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 CSH1P0DML2 217 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 CSH2P0DML3 217 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 CHN1P15882 459 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 GRB14Q14449 540 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 RBBP7Q16576 425 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 CCNJLQ8IV13 435 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 CORO1BQ9BR76 489 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 TTPALQ9BTX7 342 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 TMEM120BA0PK00 339 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 KDELR1P24390 212 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 POLE2P56282 527 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 CNPY4Q8N129 248 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 NUP93Q8N1F7 819 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 GPR152Q8TDT2 470 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 TRIM33Q9UPN9 1127 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 RCCD1A6NED2 376 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 OPHN1O60890 802 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 STX3Q13277 289 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 OLFML2BQ68BL8 750 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 SGF29Q96ES7 293 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 TSPAN18Q96SJ8 248 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 TSSK1BQ9BXA7 367 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 FZD8Q9H461 694 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 ZFP69BQ9UJL9 534 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 ENO4A6NNW6 628 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 O00370 1275 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 HAUS5O94927 633 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 TPGS1Q6ZTW0 290 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 KIRREL3Q8IZU9 778 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 RAB42Q8N4Z0 105 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 KAT2BQ92831 832 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 SCOCQ9UIL1 159 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 CYP1A2P05177 515 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 ATAD1Q8NBU5 361 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 HDAC7Q8WUI4 952 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 GRID1Q9ULK0 1009 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 MAP3K7O43318 606 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 CXCL14O95715 111 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 SATB1Q01826 763 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 FSTL1Q12841 308 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 DUSP4Q13115 394 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 MTA1Q13330 715 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 C16orf59Q7L2K0 433 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 KATNAL2Q8IYT4 538 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 PPP1R36Q96LQ0 422 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 CHST7Q9NS84 486 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN6-205ENST00000588238 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 341.9 ms