RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586027.5

GIPC1-205, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, human

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIPC1-205	ENST00000586027	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	TRIM7	Q9C029	511 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	RRN3	Q9NYV6	651 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	ANKRD62	A6NC57	917 aa		32.68	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	NME3	Q13232	169 aa		32.68	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	EML3	Q32P44	896 aa		32.68	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		32.68	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	EBF3	Q9H4W6	596 aa		32.68	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	PIGV	Q9NUD9	493 aa		32.68	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	LCA5L	O95447	670 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	CYP1A2	P05177	515 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	GPD1	P21695	349 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	IFNAR2	P48551	515 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	RING1	Q06587	406 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	DENND1C	Q8IV53	801 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		32.66	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	SDC4	P31431	198 aa		32.66	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	PTPN9	P43378	593 aa		32.66	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	ATP11A	P98196	1134 aa		32.66	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	PDGFRL	Q15198	375 aa		32.66	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	H2AFV	Q71UI9	128 aa		32.66	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	TTC8	Q8TAM2	541 aa		32.66	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	IRF7	Q92985	503 aa		32.66	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	COL4A2	P08572	1712 aa		32.65	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		32.65	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	DCLK3	Q9C098	648 aa		32.65	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		32.65	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		32.65	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	NDUFA10	O95299	355 aa		32.64	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	GBP1	P32455	592 aa		32.64	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	ZXDA	P98168	799 aa		32.64	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		32.64	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	CDO1	Q16878	200 aa		32.64	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		32.64	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		32.64	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		32.64	■■■□□ 2.82
GIPC1-205	ENST00000586027	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	CCP110	O43303	1012 aa		32.63	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	DCX	O43602	365 aa		32.63	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	ENDOD1	O94919	500 aa		32.63	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	TMEM253	P0C7T8	217 aa		32.63	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	DEUP1	Q05D60	604 aa		32.63	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	DNASE1L2	Q92874	299 aa		32.63	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	NUP85	Q9BW27	656 aa		32.63	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		32.63	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		32.63	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		32.62	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	CXCR3	P49682	368 aa		32.62	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	RUNX3	Q13761	415 aa		32.62	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		32.62	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	ATP2A3	Q93084	1043 aa		32.62	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	P2RY11	Q96G91	374 aa		32.62	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		32.62	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	COL4A3	Q01955	1670 aa		32.62	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027		I6L893	689 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	CYP17A1	P05093	508 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	OTUB2	Q96DC9	234 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	CNPY3	Q9BT09	278 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	ECT2	Q9H8V3	914 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	32.61	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	TFR2	Q9UP52	801 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	F9	P00740	461 aa		32.6	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	CCR1	P32246	355 aa		32.6	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	MAGEA1	P43355	309 aa		32.6	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	SOX9	P48436	509 aa		32.6	■■■□□ 2.81
GIPC1-205	ENST00000586027	HDAC4	P56524	1084 aa		32.6	■■■□□ 2.81

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