RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-211	ENST00000582232	MDM4	O15151	490 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	CKM	P06732	381 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	CCR1	P32246	355 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	TBX4	P57082	545 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	NME3	Q13232	169 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	CLUL1	Q15846	466 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	LRRC38	Q5VT99	294 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	DAAM2	Q86T65	1068 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	MIB1	Q86YT6	1006 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	ADAM32	Q8TC27	787 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	PPM1E	Q8WY54	764 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	ING5	Q8WYH8	240 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	SMARCD2	Q92925	531 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	NTAN1	Q96AB6	310 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	ASB16	Q96NS5	453 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	TDP1	Q9NUW8	608 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	OBP2A	Q9NY56	170 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	CPQ	Q9Y646	472 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	SLC12A8	A0AV02	714 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	KIF5C	O60282	957 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	GREM1	O60565	184 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	PALM	O75781	387 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	STC2	O76061	302 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	LATS1	O95835	1130 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	LAMP2	P13473	410 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	COMT	P21964	271 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	MIP	P30301	263 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	ZXDB	P98169	803 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	SCAP	Q12770	1279 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	CDO1	Q16878	200 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	RAB6C	Q53S08	254 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	BOLA3	Q53S33	107 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	HTR3D	Q70Z44	454 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	CD101	Q93033	1021 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	E2F7	Q96AV8	911 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	MYADM	Q96S97	322 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	DCLK3	Q9C098	648 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	WDCP	Q9H6R7	721 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	USP18	Q9UMW8	372 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-211	ENST00000582232	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		11.96	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	E2F8	A0AVK6	867 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	LEFTY2	O00292	366 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	PRPSAP2	O60256	369 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	PRAMEF12	O95522	483 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	ADRA1B	P35368	520 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	KCNQ1	P51787	676 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	USP4	Q13107	963 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF77	Q15935	545 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232		Q6ZNB5	142 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	FAM131B	Q86XD5	332 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	TEKT4	Q8WW24	435 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	C1orf74	Q96LT6	269 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	HAPLN3	Q96S86	360 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-211	ENST00000582232	GKN1	Q9NS71	199 aa		11.95	□□□□□ -0.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms