RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581578.5

GPS1-215, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 4

Gene GPS1, Length 470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-215	ENST00000581578	SERPINB11	Q96P15	392 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	PLK2	Q9NYY3	685 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	COX16	Q9P0S2	106 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	LRRC53	A6NM62	1247 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	CBFA2T2	O43439	604 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	ATG13	O75143	517 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	TULP3	O75386	442 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	KAT7	O95251	611 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	GRIA2	P42262	883 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	GABRB2	P47870	512 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	CXCL12	P48061	93 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	SEC13	P55735	322 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	RING1	Q06587	406 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	TCF15	Q12870	199 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	CCIN	Q13939	588 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	FBXO43	Q4G163	708 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	ADGRF1	Q5T601	910 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578		Q6ZS52	159 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	TAC4	Q86UU9	113 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	C12orf40	Q86WS4	652 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	XYLT1	Q86Y38	959 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	IER2	Q9BTL4	223 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	DDIT4	Q9NX09	232 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24	2e-6	■■□□□ 13.1
GPS1-215	ENST00000581578	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	ACSL4	O60488	711 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	RNF40	O75150	1001 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	APOE	P02649	317 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	NOS2	P35228	1153 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	CCR3	P51677	355 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	ZNF445	P59923	1031 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	NME3	Q13232	169 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	GAS6	Q14393	721 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	PPP2R5D	Q14738	602 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	MPPE1	Q53F39	396 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	C2orf27A	Q580R0	203 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	CPXM2	Q8N436	756 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	MARK1	Q9P0L2	795 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578		K7EQS6	105 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578		M0QYT0	321 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	TRIM24	O15164	1050 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	DAB1	O75553	588 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	LATS1	O95835	1130 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	IGLV3-27	P01718	113 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	SP9	P0CG40	484 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	SLC2A3	P11169	496 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	SKIL	P12757	684 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	MMP8	P22894	467 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	MATK	P42679	507 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	TNFRSF4	P43489	277 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	DGKG	P49619	791 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	FIGN	Q5HY92	759 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	EMC10	Q5UCC4	262 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	TSSK4	Q6SA08	328 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	AZIN2	Q96A70	460 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GPS1-215	ENST00000581578	SLC39A13	Q96H72	371 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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