RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 CD27P26842 260 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 ACSL1P33121 698 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 CHKAP35790 457 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 CTSKP43235 329 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 CLDN6P56747 220 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 C21orf59P57076 290 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 PSMD6Q15008 389 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 C10orf120Q5SQS8 335 aa9.59□□□□□ -0.87
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PTPRM-210ENST00000578916 LAYNQ6UX15 382 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZNB5 142 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 TADA2BQ86TJ2 420 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 ACOT1Q86TX2 421 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC65Q8IXS2 484 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 FUKQ8N0W3 1084 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 ZMIZ2Q8NF64 920 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 SMOQ99835 787 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-210ENST00000578916 CIPCQ9C0C6 399 aa9.59□□□□□ -0.87
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PTPRM-210ENST00000578916 CYP26A1O43174 497 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-210ENST00000578916 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-210ENST00000578916 TIMM44O43615 452 aa9.58□□□□□ -0.88
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PTPRM-210ENST00000578916 C1SP09871 688 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC130P13994 396 aa9.58□□□□□ -0.88
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PTPRM-210ENST00000578916 SORCS1Q8WY21 1168 aa9.58□□□□□ -0.88
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PTPRM-210ENST00000578916 TSPAN3O60637 253 aa9.57□□□□□ -0.88
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PTPRM-210ENST00000578916 TMEM176AQ96HP8 235 aa9.57□□□□□ -0.88
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PTPRM-210ENST00000578916 SLC2A11Q9BYW1 496 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-210ENST00000578916 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-210ENST00000578916 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-210ENST00000578916 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-210ENST00000578916 NAGPAQ9UK23 515 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-210ENST00000578916 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa9.57□□□□□ -0.88
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