RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 LOXL4Q96JB6 756 aa17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 NOX5Q96PH1 765 aa17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 MIS12Q9H081 205 aa17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 LHX5Q9H2C1 402 aa17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIK3R2O00459 728 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGLV3-27P01718 113 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 NCAM1P13591 858 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 PXNP49023 591 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDCLQ13371 301 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 MPPE1Q53F39 396 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADGRF1Q5T601 910 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCUBE3Q8IX30 993 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM71AQ8IYT1 594 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCLK2Q8N568 766 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLEC4CQ8WTT0 213 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 AZIN2Q96A70 460 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM149B1Q96BN6 582 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 SERPINB11Q96P15 392 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEP83Q9Y592 693 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 E5RJQ4 531 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 SGK1O00141 431 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 NPC1O15118 1278 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 CISD3P0C7P0 127 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 NTSR1P30989 418 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT9P35527 623 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC11A2P49281 568 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYL5Q02045 173 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 EMC10Q5UCC4 262 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 SDE2Q6IQ49 451 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 POPDC2Q9HBU9 364 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACP6Q9NPH0 428 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLCB1Q9NQ66 1216 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYTH4Q9UIA0 394 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 TLR6Q9Y2C9 796 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 GFRA2O00451 464 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 IRAK2O43187 625 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 MSI1O43347 362 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADAM23O75077 832 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 GLI1P08151 1106 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 UCHL3P15374 230 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 HOXC13P31276 330 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLCN1P35523 988 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBX4P57082 545 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNMA1Q12791 1236 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAPGEF1Q13905 1077 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT31Q15323 416 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 LPAL2Q16609 132 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM92Q6UXU6 159 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDI1Q8WTU0 396 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 BHMTQ93088 406 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASNSD1Q9NWL6 643 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 DLL3Q9NYJ7 618 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLK2Q9NYY3 685 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEP250Q9BV73 2442 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 CAPN9O14815 690 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM24O15164 1050 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 FYNP06241 537 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 LMNB2Q03252 620 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 ELF2Q15723 593 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 EFHC1Q5JVL4 640 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 FKBP15Q5T1M5 1219 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 MPP7Q5T2T1 576 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANO7Q6IWH7 933 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC47A2Q86VL8 602 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHPFQ8IZ52 775 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 MDGA1Q8NFP4 955 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 UCMAQ8WVF2 138 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 GABRG3Q99928 467 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 STK33Q9BYT3 514 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 FANCLQ9NW38 375 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAB2Q9NYJ8 693 aa17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms