RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564584.1

CTU2-205, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 896 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-205ENST00000564584 GDF9O60383 454 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CHRNB2P17787 502 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 HDCP19113 662 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 IFNAR2P48551 515 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 PSEN1P49768 467 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 TKTL1P51854 596 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 PDCLQ13371 301 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 FBXO43Q4G163 708 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 HGSNATQ68CP4 663 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 PMF1Q6P1K2 205 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 TMEM110Q86TL2 294 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ERICH1Q86X53 443 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 PASD1Q8IV76 773 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 IRGQQ8WZA9 623 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 FBXO32Q969P5 355 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CCDC42Q96M95 316 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 SYT11Q9BT88 431 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ST7Q9NRC1 585 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 STRIP2Q9ULQ0 834 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 SCML2Q9UQR0 700 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 USP3Q9Y6I4 520 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 PTPRDP23468 1912 aa14.64□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 C2orf78A6NCI8 922 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ZBED1O96006 694 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CALB1P05937 261 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 SKILP12757 684 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 PFKLP17858 780 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 NOMO3P69849 1222 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CENPCQ03188 943 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 NR1H3Q13133 447 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 EML3Q32P44 896 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 PPM1JQ5JR12 505 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 NAA35Q5VZE5 725 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CCDC186Q7Z3E2 898 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 KBTBD6Q86V97 674 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 GOLGA1Q92805 767 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CD101Q93033 1021 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ATP2A3Q93084 1043 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 TRIM11Q96F44 468 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 AKR1B10O60218 316 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 EPN2O95208 641 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ADRB1P08588 477 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ZNF806P0C7X5 589 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 UNGP13051 313 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 SCNN1AP37088 669 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 RGS7P49802 495 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ADIGQ0VDE8 80 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 USP4Q13107 963 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 WDR59Q6PJI9 974 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 SYT13Q7L8C5 426 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 WDTC1Q8N5D0 677 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 C18orf8Q96DM3 657 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 TULP2O00295 520 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 RTN2O75298 545 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 GLI1P08151 1106 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 LCP1P13796 627 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 TCF3P15923 654 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 FECHP22830 423 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 MMP8P22894 467 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-205ENST00000564584 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms