RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	STK32A	Q8WU08	396 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	SHC3	Q92529	594 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ACOX2	Q99424	681 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	SIX2	Q9NPC8	291 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		22.74	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	THADA	Q6YHU6	1953 aa		22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	NUP205	Q92621	2012 aa		22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PQF6	199 aa		22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV3-27	P01718	113 aa		22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	LTF	P02788	710 aa		22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	NTSR1	P30989	418 aa		22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	MAN2A1	Q16706	1144 aa		22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	MIIP	Q5JXC2	388 aa		22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	GABRG3	Q99928	467 aa		22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	INVS	Q9Y283	1065 aa		22.73	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	22.72	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		22.72	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	LATS1	O95835	1130 aa		22.72	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	GNA15	P30679	374 aa		22.72	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	22.72	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	C11orf74	Q86VG3	221 aa		22.72	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	22.72	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	MIS12	Q9H081	205 aa		22.72	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	DACH1	Q9UI36	760 aa		22.72	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	22.72	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	MED7	O43513	233 aa		22.71	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	22.71	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	RHOBTB1	O94844	696 aa		22.71	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF806	P0C7X5	589 aa		22.71	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	SDHB	P21912	280 aa		22.71	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	BCKDHB	P21953	392 aa		22.71	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	P2RY2	P41231	377 aa		22.71	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ELF2	Q15723	593 aa		22.71	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		22.71	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	GEN1	Q17RS7	908 aa		22.71	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	22.71	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ADGRF1	Q5T601	910 aa		22.71	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	PMS2CL	Q68D20	193 aa		22.71	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM110	Q86TL2	294 aa		22.71	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		22.71	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	CHPF	Q8IZ52	775 aa		22.71	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	HMGB4	Q8WW32	186 aa		22.71	■■□□□ 1.23
PPP4C-205	ENST00000563200	THAP12	O43422	761 aa		22.7	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CYBB	P04839	570 aa		22.7	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXB2	P14652	356 aa		22.7	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	WAS	P42768	502 aa		22.7	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	22.7	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXK2	Q01167	660 aa		22.7	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	RING1	Q06587	406 aa		22.7	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC6	Q16204	474 aa		22.7	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		22.7	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	GPT2	Q8TD30	523 aa		22.7	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	DDI1	Q8WTU0	396 aa		22.7	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		22.7	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	NDST4	Q9H3R1	872 aa		22.7	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	ST7	Q9NRC1	585 aa		22.7	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	22.69	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	GABRG2	P18507	467 aa		22.69	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	22.69	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	GBP1	P32455	592 aa		22.69	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	MPL	P40238	635 aa		22.69	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	ACADSB	P45954	432 aa		22.69	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF445	P59923	1031 aa		22.69	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	VWA3B	Q502W6	1294 aa		22.69	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	MPPE1	Q53F39	396 aa		22.69	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		22.69	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	22.69	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	BEND5	Q7L4P6	421 aa		22.69	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		22.69	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		22.69	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	FRMD1	Q8N878	549 aa		22.69	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	RLN3	Q8WXF3	142 aa		22.69	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA1	Q92805	767 aa		22.69	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		22.69	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	22.68	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	GDF9	O60383	454 aa		22.68	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	ENPP2	Q13822	863 aa		22.68	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	22.68	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		22.68	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF43	Q68DV7	783 aa		22.68	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	NETO1	Q8TDF5	533 aa		22.68	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	22.68	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	22.68	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	AZIN2	Q96A70	460 aa		22.68	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	22.68	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		22.68	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	22.68	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	22.68	■■□□□ 1.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	22.68	■■□□□ 1.22

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