RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557519.1

RPS29-208, Transcript of ribosomal protein S29, human

TSL 3

Gene RPS29, Length 333 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS29-208	ENST00000557519	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	DMC1	Q14565	340 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	C2orf27A	Q580R0	203 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	ADGRF1	Q5T601	910 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	TSSK4	Q6SA08	328 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	CEP68	Q76N32	757 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	TMEM25	Q86YD3	366 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	PASD1	Q8IV76	773 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	NAT16	Q8N8M0	369 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	USP33	Q8TEY7	942 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	NELL1	Q92832	810 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	AZIN2	Q96A70	460 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	EPC1	Q9H2F5	836 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	NCDN	Q9UBB6	729 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RPS29-208	ENST00000557519	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519		K7EQS6	105 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	GREM1	O60565	184 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	LILRB5	O75023	590 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	SERPINC1	P01008	464 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	TPM3	P06753	285 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	ZNF18	P17022	549 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	ABCB4	P21439	1286 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	CLCN1	P35523	988 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	TIE1	P35590	1138 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	SOX5	P35711	763 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	SCNN1A	P37088	669 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	APBA1	Q02410	837 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	KCNMA1	Q12791	1236 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	GAS6	Q14393	721 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	ERICH1	Q86X53	443 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	RUBCN	Q92622	972 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	RNF34	Q969K3	372 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	SPACA7	Q96KW9	195 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	SYCE3	A1L190	88 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519		K7ESF4	209 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	GFRA2	O00451	464 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	AXIN1	O15169	862 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	TIMM44	O43615	452 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	ACSL4	O60488	711 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	DAB1	O75553	588 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	GFPT2	O94808	682 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	CALCA	P01258	141 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	TDGF1	P13385	188 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	NTSR1	P30989	418 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	CCR1	P32246	355 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	SLC6A11	P48066	632 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	FNTB	P49356	437 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	CDR2	Q01850	454 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	SLC6A3	Q01959	620 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	STARD3	Q14849	445 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	ELF2	Q15723	593 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	GAB4	Q2WGN9	574 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	DCAF6	Q58WW2	860 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS29-208	ENST00000557519	MPP7	Q5T2T1	576 aa		10.13	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms