RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222		A0A1B0GVT2	93 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	KCNJ18	B7U540	433 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	NDUFS2	O75306	463 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	HLA-DRA	P01903	254 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TCF3	P15923	654 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	ZNF18	P17022	549 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	BDNF	P23560	247 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TNFRSF4	P43489	277 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	FMO5	P49326	533 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	MXI1	P50539	228 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	CACNA2D1	P54289	1103 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	ZNF445	P59923	1031 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	IL9R	Q01113	521 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	KCNH2	Q12809	1159 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	SMARCB1	Q12824	385 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	CACUL1	Q86Y37	369 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	GPR174	Q9BXC1	333 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	GMIP	Q9P107	970 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	14.57	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	SMTNL1	A8MU46	457 aa		14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	PRRT4	C9JH25	899 aa		14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	PIK3CA	P42336	1068 aa		14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	CFHR1	Q03591	330 aa		14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	KCNJ12	Q14500	433 aa		14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	MYLPF	Q96A32	169 aa		14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	P2RY11	Q96G91	374 aa		14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	CBX8	Q9HC52	389 aa		14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	NME7	Q9Y5B8	376 aa		14.56	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	MEI4	A8MW99	385 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TK2	O00142	265 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	P4HA2	O15460	535 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	NTSR1	P30989	418 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	SLC7A9	P82251	487 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	MYL7	Q01449	175 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	MAN2A1	Q16706	1144 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	ANO4	Q32M45	955 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	ZNF699	Q32M78	642 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	MIIP	Q5JXC2	388 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	CHPF	Q8IZ52	775 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TAF4B	Q92750	862 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	SEMA4D	Q92854	862 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	ACBD6	Q9BR61	282 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	RAB20	Q9NX57	234 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222		A0A1B0GTW7	788 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	ARHGAP6	O43182	974 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	HUS1	O60921	280 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	ADH1C	P00326	375 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	PDGFRB	P09619	1106 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	IRF1	P10914	325 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	NCAM1	P13591	858 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	GNS	P15586	552 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	GRIK1	P39086	918 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	MATK	P42679	507 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TAF10	Q12962	218 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	DPH6	Q7L8W6	267 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TERB1	Q8NA31	727 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	ARID3A	Q99856	593 aa		14.54	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TSPY26P	Q9H489	355 aa		14.54	□□□□□ -0.08

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