RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 APC2O95996 2303 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 CER1O95813 267 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 HLA-DRAP01903 254 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 P4HA1P13674 534 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 PIK3CAP42336 1068 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 IL9RQ01113 521 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 DENND1CQ8IV53 801 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 MMRN2Q9H8L6 949 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 SNX11Q9Y5W9 270 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 ACACAQ13085 2346 aa16.92■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 KNL1Q8NG31 2342 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 TRABD2BA6NFA1 517 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 STX6O43752 255 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 TSPAN3O60637 253 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 PENKP01210 267 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 KIF11P52732 1056 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 AP3M2P53677 418 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 STK4Q13043 487 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 KIF19Q2TAC6 998 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 ZACNQ401N2 412 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 ZNF394Q53GI3 561 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 CEP135Q66GS9 1140 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 TMEM215Q68D42 235 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 CNNM4Q6P4Q7 775 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 SV2AQ7L0J3 742 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 GLRX5Q86SX6 157 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 UNC93AQ86WB7 457 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 CADM4Q8NFZ8 388 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 UCMAQ8WVF2 138 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 NUP58Q9BVL2 599 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 ELOVL2Q9NXB9 296 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa16.91■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 SLC12A8A0AV02 714 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 CUTAO60888 179 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 PPP6R2O75170 966 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 ASS1P00966 412 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 RALAP11233 206 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 OXTRP30559 389 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 ACSL1P33121 698 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 CLDN6P56747 220 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 CLDN10P78369 228 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 C1orf216Q8TAB5 229 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 DDI1Q8WTU0 396 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 DCBLD2Q96PD2 775 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 DMAC2Q9NW81 257 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 CKAP5Q14008 2032 aa16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 URB1O60287 2271 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CS-227ENST00000551441 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 TRIM49P0CI25 452 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 TRIM49CP0CI26 452 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 ARID5AQ03989 594 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 ENPP2Q13822 863 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 KCNT1Q5JUK3 1230 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 KLHDC10Q6PID8 442 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 ARID3AQ99856 593 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 NT5C1AQ9BXI3 368 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 SERTAD1Q9UHV2 236 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 FLRT2O43155 660 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 KLRC4O43908 158 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 FSBPO95073 299 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 NR3C1P04150 777 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 PRB1P04280 392 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 RPN1P04843 607 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 CHKAP35790 457 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 GCLMP48507 274 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 IL27RAQ6UWB1 636 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 DHRS13Q6UX07 377 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 DUSP16Q9BY84 665 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 LHX5Q9H2C1 402 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 TM9SF3Q9HD45 589 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 ZNF510Q9Y2H8 683 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-227ENST00000551441 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms