RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539135.1

CCND2-AS1-201, CCND2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCND2-AS1, Length 555 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2-AS1-201ENST00000539135 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 SLC38A8A6NNN8 435 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 LIASO43766 372 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 TLL1O43897 1013 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 SEC24AO95486 1093 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 ECEL1O95672 775 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 ATF2P15336 505 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 DRG2P55039 364 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 RBM10P98175 930 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 CREMQ03060 361 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 LMNB2Q03252 620 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 DUPD1Q68J44 220 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 TMCO3Q6UWJ1 677 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 TAC4Q86UU9 113 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 JAMLQ86YT9 394 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 STKLD1Q8NE28 680 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 GIPC2Q8TF65 315 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 RNF139Q8WU17 664 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 IFT81Q8WYA0 676 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 SEC14L1Q92503 715 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 DPF3Q92784 378 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 FBXO32Q969P5 355 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 NTAN1Q96AB6 310 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 FAF2Q96CS3 445 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 ZNF670Q9BS34 389 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 MAGEB5Q9BZ81 275 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 RAB17Q9H0T7 212 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 WDCPQ9H6R7 721 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 NMUR1Q9HB89 426 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 RXFP1Q9HBX9 757 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 ARFGAP3Q9NP61 516 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 PATJQ8NI35 1801 aa12.32□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 PTPRSQ13332 1948 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 CXCL14O95715 111 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 IGLV3-25P01717 112 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 APOC2P02655 101 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 CTSAP10619 480 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 BMPR1AP36894 532 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 CARSP49589 748 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 DYNLT1P63172 113 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 SCAPQ12770 1279 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 TAF10Q12962 218 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 MTMR3Q13615 1198 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 CUL1Q13616 776 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 TRADDQ15628 312 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 ARL13BQ3SXY8 428 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 MAP9Q49MG5 647 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 EFHC2Q5JST6 749 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 RASIP1Q5U651 963 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 PYROXD2Q8N2H3 581 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 PLD5Q8N7P1 536 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 KLHL23Q8NBE8 558 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 PCDH19Q8TAB3 1148 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 SLC35B2Q8TB61 432 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 AUTS2Q8WXX7 1259 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 RNF34Q969K3 372 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 HS3ST6Q96QI5 342 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 FAM118BQ9BPY3 351 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 TRIM51Q9BSJ1 452 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 TTLL2Q9BWV7 592 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 ZBP1Q9H171 429 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 FAM114A2Q9NRY5 505 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 OSER1Q9NX31 292 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 CLIC5Q9NZA1 410 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 GMIPQ9P107 970 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 DNPEPQ9ULA0 475 aa12.31□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 ESYT3A0FGR9 886 aa12.3□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 APOL1O14791 398 aa12.3□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 DAPK3O43293 454 aa12.3□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 GAS8O95995 478 aa12.3□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 MYBL2P10244 700 aa12.3□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 ATF6P18850 670 aa12.3□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 ELF1P32519 619 aa12.3□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 ARL4AP40617 200 aa12.3□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 ALDH1A3P47895 512 aa12.3□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 VCPP55072 806 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 PPP1R7Q15435 360 aa12.3□□□□□ -0.44
CCND2-AS1-201ENST00000539135 SLC9A4Q6AI14 798 aa12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms