RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RBBP4-215	ENST00000524393	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	GFRA2	O00451	464 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	NPC1	O15118	1278 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	ADAM23	O75077	832 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	CALCA	P01258	141 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF806	P0C7X5	589 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC9A1	P19634	815 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	WAS	P42768	502 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	CREB5	Q02930	508 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	ARID5A	Q03989	594 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	PMS2CL	Q68D20	193 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	FBXO10	Q9UK96	956 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	PRRT4	C9JH25	899 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	CAPN9	O14815	690 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	CISD3	P0C7P0	127 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	NCAM1	P13591	858 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	P2RY2	P41231	377 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	GPD2	P43304	727 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC11A2	P49281	568 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	PTK2	Q05397	1052 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	STARD3	Q14849	445 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	CCDC6	Q16204	474 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	ADGRF1	Q5T601	910 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	STK32A	Q8WU08	396 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	SERPINB11	Q96P15	392 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	MED15	Q96RN5	788 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	TSPAN3	O60637	253 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF217	O75362	1048 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	CAVIN2	O95810	425 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	GABRG2	P18507	467 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	PON1	P27169	355 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	DPP6	P42658	865 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	TBX4	P57082	545 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	SNX16	P57768	344 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	RING1	Q06587	406 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	VWA3B	Q502W6	1294 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	IL31	Q6EBC2	164 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	GJB7	Q6PEY0	223 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	RLN3	Q8WXF3	142 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	NOX5	Q96PH1	765 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	ACOX2	Q99424	681 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	GABRG3	Q99928	467 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	CIPC	Q9C0C6	399 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	NDST4	Q9H3R1	872 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	CEP83	Q9Y592	693 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393		A0A1W2PQF6	199 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC30A4	O14863	429 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	IRAK2	O43187	625 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	AP5Z1	O43299	807 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	TIMM44	O43615	452 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	GABBR2	O75899	941 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	TPM2	P07951	284 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	BCKDHB	P21953	392 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31

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