RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702		E7EVH7	732 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF185	O15231	689 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	COQ9	O75208	318 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	KIF20A	O95235	890 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	ACADM	P11310	421 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	CPA1	P15085	419 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	MST1	P26927	711 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	ARL3	P36405	182 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	PLA2G5	P39877	138 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	GPS1	Q13098	491 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	MPP3	Q13368	585 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	WTAP	Q15007	396 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	STAM	Q92783	540 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	DERA	Q9Y315	318 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	STX16	O14662	325 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	DCLK1	O15075	740 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	KLK10	O43240	276 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNQ3	O43525	872 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	PTP4A3	O75365	173 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM63A	O94886	807 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	YY1	P25490	414 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	GGT5	P36269	586 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	PGM1	P36871	562 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	UBA7	P41226	1012 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	VIPR2	P41587	438 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	WNT3	P56703	355 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	REST	Q13127	1097 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	PDCL	Q13371	301 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702		Q8NA96	180 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	CPT1B	Q92523	772 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	PNKP	Q96T60	521 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM49B-222	ENST00000522702	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.39	□□□□□ -1.71

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