RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522635.5

TCEA1-211, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TCEA1, Length 1,432 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-211ENST00000522635 ATAT1Q5SQI0 421 aa24.39■■□□□ 1.5
TCEA1-211ENST00000522635 LRRC38Q5VT99 294 aa24.39■■□□□ 1.5
TCEA1-211ENST00000522635 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.5
TCEA1-211ENST00000522635 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
TCEA1-211ENST00000522635 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
TCEA1-211ENST00000522635 PCSK1NQ9UHG2 260 aa24.39■■□□□ 1.5
TCEA1-211ENST00000522635 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
TCEA1-211ENST00000522635 JRKLQ9Y4A0 524 aa24.39■■□□□ 1.5
TCEA1-211ENST00000522635 FANCGO15287 622 aa24.38■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 PSTPIP1O43586 416 aa24.38■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 MARCKSL1P49006 195 aa24.38■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 RING1Q06587 406 aa24.38■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 PPP2R5DQ14738 602 aa24.38■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 HADHQ16836 314 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 SCYL2Q6P3W7 929 aa24.38■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 POLNQ7Z5Q5 900 aa24.38■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 RHOT1Q8IXI2 618 aa24.38■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 CCDC185Q8N715 623 aa24.38■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.38■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 HES6Q96HZ4 224 aa24.38■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 RIPOR3Q96MK2 946 aa24.38■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 CD207Q9UJ71 328 aa24.38■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 HELZP42694 1942 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 CTNNA2P26232 953 aa24.37■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 CCR1P32246 355 aa24.37■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 MTHFRP42898 656 aa24.37■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 CLUL1Q15846 466 aa24.37■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 BRMS1LQ5PSV4 323 aa24.37■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa24.37■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 POTEHQ6S545 545 aa24.37■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 NPAS3Q8IXF0 933 aa24.37■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 CMTM8Q8IZV2 173 aa24.37■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 KRT35Q92764 455 aa24.37■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 NTAN1Q96AB6 310 aa24.37■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 TLR10Q9BXR5 811 aa24.37■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa24.37■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 CPQQ9Y646 472 aa24.37■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 CCDC66A2RUB6 948 aa24.36■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 GJC1P36383 396 aa24.36■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 COG7P83436 770 aa24.36■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 PLD4Q96BZ4 506 aa24.36■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 ZWILCHQ9H900 591 aa24.36■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 ANLNQ9NQW6 1124 aa24.36■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 SMPD4Q9NXE4 827 aa24.36■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa24.36■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa24.36■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 KCNU1A8MYU2 1149 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 I6L893 689 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 ENC1O14682 589 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 KRT7P08729 469 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 SLC2A3P11169 496 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 TNNT1P13805 278 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 AVPR1AP37288 418 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 KCNQ1P51787 676 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 AIF1P55008 147 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 SCAPQ12770 1279 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 SMTNL2Q2TAL5 461 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 SYT10Q6XYQ8 523 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 TEKT4Q8WW24 435 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 FGF13Q92913 245 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 RNF34Q969K3 372 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 ZSWIM3Q96MP5 696 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 TKTL2Q9H0I9 626 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 WDCPQ9H6R7 721 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 DNAI1Q9UI46 699 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 H3BQ06 376 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 STC2O76061 302 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 APOEP02649 317 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 TUBB4AP04350 444 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 HMBSP08397 361 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 ADRA1BP35368 520 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 ZXDBP98169 803 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 RPS6KA1Q15418 735 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 BOLA3Q53S33 107 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 NUGGCQ68CJ6 796 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 SUSD6Q92537 303 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 ALG3Q92685 438 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 NECTIN4Q96NY8 510 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 GKN1Q9NS71 199 aa24.35■■□□□ 1.49
TCEA1-211ENST00000522635 FZD10Q9ULW2 581 aa24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms