RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 MYF5P13349 255 aa5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 YY1P25490 414 aa5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 DGKQP52824 942 aa5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 IGBP1P78318 339 aa5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 MTA1Q13330 715 aa5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 CNGA3Q16281 694 aa5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 DLK2Q6UY11 383 aa5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 RFX8Q6ZV50 586 aa5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 SKAP1Q86WV1 359 aa5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 UEVLDQ8IX04 471 aa5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 SLC44A5Q8NCS7 719 aa5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 FAM227BQ96M60 508 aa5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 ZPBPQ9BS86 351 aa5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 VPS33BQ9H267 617 aa5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 SAP30LQ9HAJ7 183 aa5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 ZNF212Q9UDV6 495 aa5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 COG5Q9UP83 839 aa5.68□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 C16orf96A6NNT2 1141 aa5.67□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 ZNF814B7Z6K7 855 aa5.67□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 PRSS44E7EML9 344 aa5.67□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 NDUFB8O95169 186 aa5.67□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 EPN2O95208 641 aa5.67□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 ST6GAL1P15907 406 aa5.67□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 TFEBP19484 476 aa5.67□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 MTAPQ13126 283 aa5.67□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa5.67□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.67□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 CCDC149Q6ZUS6 474 aa5.67□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa5.67□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 MSLNLQ96KJ4 702 aa5.67□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 TMEM204Q9BSN7 226 aa5.67□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.67□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 NCAPD3P42695 1498 aa5.66□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 TTC34A8MYJ7 566 aa5.66□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 MGEA5O60502 916 aa5.66□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 ZNF585BQ52M93 769 aa5.66□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 FAM102BQ5T8I3 360 aa5.66□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa5.66□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.66□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 ABHD10Q9NUJ1 306 aa5.66□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 PCDHA12Q9UN75 941 aa5.66□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 CUX1P39880 1505 aa5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 A6NNZ2 444 aa5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 GOLIM4O00461 696 aa5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 MT-ND5P03915 603 aa5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 VPS41P49754 854 aa5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 PGGT1BP53609 377 aa5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 ZXDBP98169 803 aa5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 ACOX1Q15067 660 aa5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 ADGRF4Q8IZF3 695 aa5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 KRT78Q8N1N4 520 aa5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 SUN3Q8TAQ9 357 aa5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 SNX22Q96L94 193 aa5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 SENP7Q9BQF6 1050 aa5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 ASNSD1Q9NWL6 643 aa5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 VPS4AQ9UN37 437 aa5.65□□□□□ -1.5
SGCE-211ENST00000522045 EVPLQ92817 2033 aa5.65□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 MAP3K1Q13233 1512 aa5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 C4orf47A7E2U8 309 aa5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 DUSP1P28562 367 aa5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 IDUAP35475 653 aa5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 RHDQ02161 417 aa5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 PPATQ06203 517 aa5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 ODR4Q5SWX8 454 aa5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 PPP4R4Q6NUP7 873 aa5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 TMEM199Q8N511 208 aa5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 FAM156AQ8NDB6 213 aa5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 ASB5Q8WWX0 329 aa5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 ZNF479Q96JC4 524 aa5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 TBC1D23Q9NUY8 699 aa5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 SLC28A2O43868 658 aa5.63□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 UGDHO60701 494 aa5.63□□□□□ -1.51
SGCE-211ENST00000522045 MATN1P21941 496 aa5.63□□□□□ -1.51
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