RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521220.1

CCDC25-208, Transcript of coiled-coil domain containing 25, human

TSL 2

Gene CCDC25, Length 613 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC25-208	ENST00000521220	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	IL16	Q14005	1332 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	AP1G1	O43747	822 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	PAX7	P23759	505 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	KLRC1	P26715	233 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	GATM	P50440	423 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	BECN1	Q14457	450 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	JAK3	P52333	1124 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	TRAF1	Q13077	416 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	MAML1	Q92585	1016 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	KDR	P35968	1356 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220		H0YHG0	523 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	RRH	O14718	337 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	ACOT8	O14734	319 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	MARCH6	O60337	910 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	PIAS2	O75928	621 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	UBXN7	O94888	489 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	NDUFB8	O95169	186 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	UQCRH	P07919	91 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	PF4V1	P10720	104 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	KIT	P10721	976 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	HGF	P14210	728 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	CASQ1	P31415	396 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	ABCD1	P33897	745 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	POLD2	P49005	469 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CCDC25-208	ENST00000521220	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75

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