RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 TEX28O15482 410 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 KCNN4O15554 427 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 UPP2O95045 317 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 FAM107AO95990 144 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SKIP12755 728 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 RARGP13631 454 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SCNN1GP51170 649 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 BCAT1P54687 386 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 ROR1Q01973 937 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CAV1Q03135 178 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PRKCZQ05513 592 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB17Q13105 803 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 MMRN1Q13201 1228 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PPP2R5DQ14738 602 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 RASA2Q15283 850 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 FAXCQ5TGI0 409 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PMF1Q6P1K2 205 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CD101Q93033 1021 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 DPEP3Q9H4B8 488 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 RSAD1Q9HA92 442 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PFDN4Q9NQP4 134 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CLDN5O00501 218 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SGTAO43765 313 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 FAM189A1O60320 539 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 ASGR1P07306 291 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 APRTP07741 180 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CD48P09326 243 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 LMO2P25791 158 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 AXLP30530 894 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CD52P31358 61 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 STX2P32856 288 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 MAP3K7CLP57077 242 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 ADIGQ0VDE8 80 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PTGISQ16647 500 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 HIF1AQ16665 826 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 MDH1BQ5I0G3 518 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 ANO7Q6IWH7 933 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 LRIG3Q6UXM1 1119 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 XYLT1Q86Y38 959 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 WDTC1Q8N5D0 677 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CATSPER2Q96P56 530 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SYT15Q9BQS2 421 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 LHX5Q9H2C1 402 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 TMBIM4Q9HC24 238 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 GPR182O15218 404 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 ALDH2P05091 517 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CCNCP24863 283 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 LSP1P33241 339 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 GPD2P43304 727 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SULT1E1P49888 294 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CMPK2Q5EBM0 449 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM154Q6P9G4 183 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 RNF180Q86T96 592 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 NLRP14Q86W24 1093 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC110Q8TBZ0 833 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 AGAP11Q8TF27 550 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA17Q96L03 361 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 SIKE1Q9BRV8 207 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CXCL16Q9H2A7 254 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 WHRNQ9P202 907 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 GABRQQ9UN88 632 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CENPFP49454 3210 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 MYADML2A6NDP7 307 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 CFAP73A6NFT4 308 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 RASA4BC9J798 803 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 APOL1O14791 398 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 RASA4O43374 803 aa8.11□□□□□ -1.11
TRPS1-208ENST00000519076 KDELR1P24390 212 aa8.11□□□□□ -1.11
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