RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516278.1

RN7SKP248-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 248, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP248, Length 305 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP248-201ENST00000516278 GCNT4Q9P109 453 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 WDR37Q9Y2I8 494 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 SNX24Q9Y343 169 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 ALG6Q9Y672 507 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa6.7□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 DYTNA2CJ06 578 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 CCDC162PA2VCL2 907 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 AP1G1O43747 822 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 SPOPO43791 374 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 PEX1O43933 1283 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 ATP9AO75110 1047 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 PSMG1O95456 288 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 ASMTLO95671 621 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 FUCA1P04066 466 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 KRT1P04264 644 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 SHBGP04278 402 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 C1QTNF9P0C862 333 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 PLA2G4BP0C869 781 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 CRABP2P29373 138 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 FLT3P36888 993 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 TFAP4Q01664 338 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 MTA1Q13330 715 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 LSAMPQ13449 338 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 MED21Q13503 144 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 MOGSQ13724 837 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 KLHL38Q2WGJ6 581 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 LIN52Q52LA3 116 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 C12orf60Q5U649 245 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 VSTM1Q6UX27 236 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 TRIM74Q86UV6 250 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 TRIM73Q86UV7 250 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 ECHDC2Q86YB7 292 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 MIGA1Q8NAN2 632 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 NETO2Q8NC67 525 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 AZIN2Q96A70 460 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 PEX11GQ96HA9 241 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 FAM20AQ96MK3 541 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 NDE1Q9NXR1 346 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 SNTG2Q9NY99 539 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 ABCF2Q9UG63 623 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 ASIC3Q9UHC3 531 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 MYO3BQ8WXR4 1341 aa6.69□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 ADAMTSL3P82987 1691 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 ALS2Q96Q42 1657 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 PP2D1A8MPX8 630 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 C22orf46C9J442 243 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 CAPN9O14815 690 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 KLF11O14901 512 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 ADCY3O60266 1144 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 PFDN1O60925 122 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 PDHA1P08559 390 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 MYL4P12829 197 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 CYP3A7P24462 503 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 RANBP1P43487 201 aa6.68□□□□□ -1.34
RN7SKP248-201ENST00000516278 BPIFB4P59827 614 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms