RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514536.5

USP46-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

TSL 2

Gene USP46, Length 1,589 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-209ENST00000514536 CHKAP35790 457 aa14.53□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 OPRD1P41143 372 aa14.53□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 PRKCIP41743 596 aa14.53□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 CENPCQ03188 943 aa14.53□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.53□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.53□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 FSTL4Q6MZW2 842 aa14.53□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.53□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 NAT16Q8N8M0 369 aa14.53□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 ADAM22Q9P0K1 906 aa14.53□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.53□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 DAB1O75553 588 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 NOS2P35228 1153 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 SCNN1AP37088 669 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 MATKP42679 507 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 RING1Q06587 406 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 PTP4A2Q12974 167 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 C12orf40Q86WS4 652 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 VSTM4Q8IW00 320 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 DTWD2Q8NBA8 298 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 OLIG1Q8TAK6 271 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 BHMTQ93088 406 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 EXOC4Q96A65 974 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 SLC39A13Q96H72 371 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 BBS2Q9BXC9 721 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 TRIM5Q9C035 493 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 PLK2Q9NYY3 685 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 COX16Q9P0S2 106 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
USP46-209ENST00000514536 PIEZO1Q92508 2521 aa14.52□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 TMCO5BA8MYB1 307 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 IRAK2O43187 625 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 EGFP01133 1207 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 IGLV3-25P01717 112 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 TYRP14679 529 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 GBP1P32455 592 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 NNTQ13423 1086 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 ADGRF1Q5T601 910 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 SARM1Q6SZW1 724 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 DDIT4Q9NX09 232 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 M0QYT0 321 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 ACSL4O60488 711 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 TSPAN3O60637 253 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 GJB6O95452 261 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 CALB1P05937 261 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 DRD1P21728 446 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 SLC11A2P49281 568 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 NME3Q13232 169 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 CCINQ13939 588 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 LRRC32Q14392 662 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 HGSNATQ68CP4 663 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 MON1BQ7L1V2 547 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 FAM217AQ8IXS0 508 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 CPXM2Q8N436 756 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 RNF34Q969K3 372 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 P2RY11Q96G91 374 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 PNKPQ96T60 521 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 NPY6RQ99463 290 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 RRN3Q9NYV6 651 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 MARK1Q9P0L2 795 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 STOML2Q9UJZ1 356 aa14.51□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 TULP3O75386 442 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 LATS1O95835 1130 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 APOEP02649 317 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 CYBBP04839 570 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 SERPING1P05155 500 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 FLT3P36888 993 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 MAGEA9P43362 315 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 MESP2Q0VG99 397 aa14.5□□□□□ -0.09
USP46-209ENST00000514536 TRIM14Q14142 442 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms