RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 CLEC4EQ9ULY5 219 aa17.72■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 WASF3Q9UPY6 502 aa17.72■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 CYBBP04839 570 aa17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 CD19P15391 556 aa17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 IL12RB1P42701 662 aa17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 BCAT1P54687 386 aa17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 FUT11Q495W5 492 aa17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 COBLL1Q53SF7 1204 aa17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 SGO2Q562F6 1265 aa17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 BHLHA9Q7RTU4 235 aa17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 RABEPKQ7Z6M1 372 aa17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 RGL4Q8IZJ4 473 aa17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 CPXM2Q8N436 756 aa17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 DDI1Q8WTU0 396 aa17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 UCMAQ8WVF2 138 aa17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 PLD4Q96BZ4 506 aa17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 GSDMAQ96QA5 445 aa17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 LRRC4Q9HBW1 653 aa17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 HESX1Q9UBX0 185 aa17.71■□□□□ 0.43
HERC3-211ENST00000513325 PI4KAP42356 2102 aa17.71■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 TRIM49BA6NDI0 452 aa17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 C1QTNF9P0C862 333 aa17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 ADIGQ0VDE8 80 aa17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 LRMPQ12912 555 aa17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 SEMA3BQ13214 749 aa17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 ENPP2Q13822 863 aa17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 FMNL3Q8IVF7 1028 aa17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 HDDC3Q8N4P3 179 aa17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 OR2I1PQ8NGU4 316 aa17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 UBA3Q8TBC4 463 aa17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 SLC35C1Q96A29 364 aa17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 ELOVL2Q9NXB9 296 aa17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa17.7■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP33O14559 1287 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 NPC1O15118 1278 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 SMC2O95347 1197 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 PROS1P07225 676 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 MAOBP27338 520 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 CD6P30203 668 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 ZNF132P52740 706 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 BST2Q10589 180 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 ZNF234Q14588 700 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 BSPRYQ5W0U4 402 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 PIP4P1Q86T03 277 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 FAM217AQ8IXS0 508 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 MINDY1Q8N5J2 469 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 UBR7Q8N806 425 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 ENGASEQ8NFI3 743 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 EDEM1Q92611 657 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 SMARCE1Q969G3 411 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 SLC2A11Q9BYW1 496 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 CIPCQ9C0C6 399 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa17.69■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 YJEFN3A6XGL0 299 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 UPK3BL1B0FP48 263 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 UPK3BL2E5RIL1 263 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 E7ENQ6 273 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 O00370 1275 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 TSPAN3O60637 253 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 OPHN1O60890 802 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 SYPP08247 313 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 VDRP11473 427 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 PRKCHP24723 683 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 HARS2P49590 506 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 LRRC63Q05C16 580 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 MPPE1Q53F39 396 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 SYCP2LQ5T4T6 812 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 TMEM215Q68D42 235 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 TMPRSS6Q8IU80 811 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 SPATA20Q8TB22 786 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 RNF139Q8WU17 664 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 SORCS1Q8WY21 1168 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 KCTD13Q8WZ19 329 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 FOXJ1Q92949 421 aa17.68■□□□□ 0.42
HERC3-211ENST00000513325 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
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