RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 DRC7Q8IY82 874 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 LRRC71Q8N4P6 559 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 RNF149Q8NC42 400 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 KAT2BQ92831 832 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 TIFAQ96CG3 184 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 NLRP4Q96MN2 994 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 NFKBIZQ9BYH8 718 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 RNF38Q9H0F5 515 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 EPHX3Q9H6B9 360 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 KIAA1586Q9HCI6 787 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 SETD4Q9NVD3 440 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 TBX20Q9UMR3 447 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa7.87□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 E2F8A0AVK6 867 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 KCNJ18B7U540 433 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 LDHAP00338 332 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 MMEP08473 750 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 NCAM1P13591 858 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 KRT13P13646 458 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 PTGS1P23219 599 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 NR2F2P24468 414 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 CLCN3P51790 818 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ACLYP53396 1101 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 UBASH3AP57075 661 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 TFF2Q03403 129 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 KCNJ12Q14500 433 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 CD276Q5ZPR3 534 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 TTI2Q6NXR4 508 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ARMCX5Q6P1M9 558 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 SARM1Q6SZW1 724 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 MPZL3Q6UWV2 235 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 SESTD1Q86VW0 696 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 FAM168AQ92567 244 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 KCNN1Q92952 543 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 TCHPQ9BT92 498 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 KCTD10Q9H3F6 313 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 STARD7Q9NQZ5 370 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 HDAC6Q9UBN7 1215 aa7.86□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 MYADML2A6NDP7 307 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 N4BP3O15049 544 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 KIAA0355O15063 1070 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 KDM1AO60341 852 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 STX10O60499 249 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 EXOC3O60645 756 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ERLIN2O94905 339 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 NR3C1P04150 777 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 PRKCBP05771 671 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ASGR2P07307 311 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 TPM1P09493 284 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 CLTBP09497 229 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 KCNQ1P51787 676 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 CASP5P51878 434 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 PTENP60484 403 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 CCDC173Q0VFZ6 552 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 CETN1Q12798 172 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ITGA7Q13683 1181 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 CAPSQ13938 189 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 KYAT1Q16773 422 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 CR1LQ2VPA4 569 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 TCP11X2Q5H9J9 407 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 C12orf56Q8IXR9 622 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 XXYLT1Q8NBI6 393 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 HIPK4Q8NE63 616 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 POMGNT1Q8WZA1 660 aa7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
HERC3-210ENST00000512194 ACAP3Q96P50 834 aa7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms