RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 ASPHQ12797 758 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 FGL2Q14314 439 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SMUG1Q53HV7 270 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 HS1BP3Q53T59 392 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.56□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 BEND4Q6ZU67 534 aa7.56□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 SYCE1Q8N0S2 351 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 CARFQ8N187 725 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF565Q8N9K5 539 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 TRPV1Q8NER1 839 aa7.56□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 C14orf79Q96F83 325 aa7.56□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 MAML3Q96JK9 1138 aa7.56□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 NUP85Q9BW27 656 aa7.56□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 LRRC19Q9H756 370 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 DCTPP1Q9H773 170 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa7.56□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 MKNK2Q9HBH9 465 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.56□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 OR6C2Q9NZP2 312 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 THEGQ9P2T0 379 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SERPINB13Q9UIV8 391 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 DERAQ9Y315 318 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.56□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 A8MV72 311 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 KRIT1O00522 736 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 GSTA4O15217 222 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 CCDC192P0DO97 292 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 BRAFP15056 766 aa7.55□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 PLCD1P51178 756 aa7.55□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 STX1BP61266 288 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 RAB1AP62820 205 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 TUBA4AP68366 448 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ATP8B2P98198 1209 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 CDK17Q00537 523 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 HSPA14Q0VDF9 509 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ARHGAP19Q14CB8 494 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 KRT31Q15323 416 aa7.55□□□□□ -1.2
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PDCD4-211ENST00000498367 MEP1BQ16820 701 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 MPP7Q5T2T1 576 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 ADALQ6DHV7 355 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 AFTPHQ6ULP2 937 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 MICALCLQ6ZW33 695 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SCML4Q8N228 414 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 TCAIMQ8N3R3 496 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SMYD1Q8NB12 490 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 SHCBP1Q8NEM2 672 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.55□□□□□ -1.2
PDCD4-211ENST00000498367 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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