RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496298.5

USP40-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-217ENST00000496298 SLC2A11Q9BYW1 496 aa20.26■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 THAP9Q9H5L6 903 aa20.26■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa20.26■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
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USP40-217ENST00000496298 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 HARS2P49590 506 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
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USP40-217ENST00000496298 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
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USP40-217ENST00000496298 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.24■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.24■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 CEP192Q8TEP8 1941 aa20.23■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 LAMA1P25391 3075 aa20.23■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.23■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 PIK3R2O00459 728 aa20.23■□□□□ 0.83
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USP40-217ENST00000496298 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
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USP40-217ENST00000496298 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.23■□□□□ 0.83
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USP40-217ENST00000496298 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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USP40-217ENST00000496298 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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USP40-217ENST00000496298 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
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USP40-217ENST00000496298 RNF43Q68DV7 783 aa20.22■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.22■□□□□ 0.83
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USP40-217ENST00000496298 RLN3Q8WXF3 142 aa20.22■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 MIS12Q9H081 205 aa20.22■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 SIX2Q9NPC8 291 aa20.22■□□□□ 0.83
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USP40-217ENST00000496298 CYTH4Q9UIA0 394 aa20.22■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
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USP40-217ENST00000496298 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 NUGGCQ68CJ6 796 aa20.21■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 KIAA1211LQ6NV74 962 aa20.21■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.21■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 UNC45BQ8IWX7 931 aa20.21■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 GOLGA1Q92805 767 aa20.21■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 SPACA7Q96KW9 195 aa20.21■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 ACP6Q9NPH0 428 aa20.21■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
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