RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494241.5

ZNF638-225, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 3

Gene ZNF638, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-225	ENST00000494241	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	NTN1	O95631	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	TRIM27	P14373	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	GABRB3	P28472	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	DUSP1	P28562	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	SLC5A2	P31639	672 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	GSTM5	P46439	218 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	MAPK7	Q13164	816 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	GAB1	Q13480	694 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	ELF2	Q15723	593 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	P3H1	Q32P28	736 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63	5e-9	■■□□□ 13.9
ZNF638-225	ENST00000494241	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	MYMK	A6NI61	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	PRY	O14603	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	KIF3B	O15066	747 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	NCK2	O43639	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	ALAD	P13716	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	MMP8	P22894	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	IDUA	P35475	653 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	ME1	P48163	572 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	MTX1	Q13505	466 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZNF638-225	ENST00000494241	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	VIP	P01282	170 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	EGR1	P18146	543 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	MATN1	P21941	496 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	SCP2	P22307	547 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	TNFSF4	P23510	183 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	NDUFS1	P28331	727 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	GDF15	Q99988	308 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241		H3BNX3	289 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	USP12	O75317	370 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	PSG1	P11464	419 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	HOXD12	P35452	270 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	AGTR2	P50052	363 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	LINC00205	P59089	165 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF638-225	ENST00000494241	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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