RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 KLC2Q9H0B6 622 aa13.31□□□□□ -0.28
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PRAME-213ENST00000492657 MFSD11O43934 449 aa13.28□□□□□ -0.28
PRAME-213ENST00000492657 GCATO75600 419 aa13.28□□□□□ -0.28
PRAME-213ENST00000492657 UNC5CO95185 931 aa13.28□□□□□ -0.28
PRAME-213ENST00000492657 CSH1P0DML2 217 aa13.28□□□□□ -0.28
PRAME-213ENST00000492657 CSH2P0DML3 217 aa13.28□□□□□ -0.28
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