RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491998.5

DFFB-211, Transcript of DNA fragmentation factor subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene DFFB, Length 3,152 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFB-211ENST00000491998 DLGAP5Q15398 846 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 CEP55Q53EZ4 464 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 DLK2Q6UY11 383 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 CROCCP3Q8IVE0 287 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 PALM2Q8IXS6 379 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 GSTCDQ8NEC7 633 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 MTMR12Q9C0I1 747 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 USP29Q9HBJ7 922 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 SLC24A2Q9UI40 661 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 PRR12Q9ULL5 1215 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 ATP2A1O14983 1001 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 PRKACAP17612 351 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 FAM102BQ5T8I3 360 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 NEK5Q6P3R8 708 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 TTC23LQ6PF05 361 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 ULK2Q8IYT8 1036 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 ZNF398Q8TD17 642 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 TELO2Q9Y4R8 837 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 SQORQ9Y6N5 450 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 SIPA1L1O43166 1804 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 PGM3O95394 542 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 WEE1P30291 646 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 TGFB2P61812 414 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 NIPAL4Q0D2K0 466 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 FAAP100Q0VG06 881 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 PLA2G4FQ68DD2 849 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 USP43Q70EL4 1123 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 RASSF3Q86WH2 238 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 IGDCC3Q8IVU1 814 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 KATNAL2Q8IYT4 538 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 MZB1Q8WU39 189 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 DCAKDQ8WVC6 231 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 VPS11Q9H270 941 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 CCSER2Q9H7U1 834 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 THAP1Q9NVV9 213 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 ZHX2Q9Y6X8 837 aa11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 ARHGAP42A6NI28 874 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 TXNDC9O14530 226 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 CYB561D2O14569 222 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 DPYSQ14117 519 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 MORF4L2Q15014 288 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 SPDYAQ5MJ70 313 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 MON1BQ7L1V2 547 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 MIER3Q7Z3K6 550 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 DTX3Q8N9I9 347 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 GALNT6Q8NCL4 622 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 HCAR2Q8TDS4 363 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 MTBPQ96DY7 904 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 SLITRK1Q96PX8 696 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 SIAEQ9HAT2 523 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 TMEM8AQ9HCN3 771 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 GPSM3Q9Y4H4 160 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 ENPP3O14638 875 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 VILLO15195 856 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 PSTPIP1O43586 416 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 PHKG1Q16816 387 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 SMTNL2Q2TAL5 461 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 SFT2D3Q587I9 215 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 CES4AQ5XG92 561 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 TATDN1Q6P1N9 297 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 SPARTQ8N0X7 666 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 ERLEC1Q96DZ1 483 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 GMLQ99445 158 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 TUBB6Q9BUF5 446 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 TEKT3Q9BXF9 490 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 NUF2Q9BZD4 464 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 GJA3Q9Y6H8 435 aa11.94□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa11.93□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 A8MX80 341 aa11.93□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 CIB2O75838 187 aa11.93□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 KRT75O95678 551 aa11.93□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 TFPTP0C1Z6 253 aa11.93□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 RARRES1P49788 294 aa11.93□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 IRX4P78413 519 aa11.93□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 SLC25A3Q00325 362 aa11.93□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 CD300CQ08708 224 aa11.93□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 CCDC14Q49A88 953 aa11.93□□□□□ -0.5
DFFB-211ENST00000491998 IGSF11Q5DX21 431 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms